RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 FSCBQ5H9T9 825 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 DCAF12L1Q5VU92 463 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRT79Q5XKE5 535 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 DSELQ8IZU8 1212 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 TEX45Q8NA69 505 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 RASL10AQ92737 203 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM104AQ969W3 186 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 R3HDM4Q96D70 268 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 CRBNQ96SW2 442 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMOQ99835 787 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 TM2D2Q9BX73 214 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 WNT5BQ9H1J7 359 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 GLOD4Q9HC38 313 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 USP35Q9P2H5 1018 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 CACNG5Q9UF02 275 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 USP18Q9UMW8 372 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNKSO95271 1327 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPTORQ8N122 1335 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 A1L4Q6 167 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 LINC01553A4QN01 128 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 A6NNZ2 444 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRR32B1ATL7 298 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 VWA5AO00534 786 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 HAT1O14929 419 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 CRTAMO95727 393 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 LY6G6DO95868 133 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 AFPP02771 609 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 CYP17A1P05093 508 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 P4HBP07237 508 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 SELLP14151 372 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 CPEP16870 476 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 TFEBP19484 476 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC5A2P31639 672 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 AMTP48728 403 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIF11P52732 1056 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 COPB1P53618 953 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 CASP7P55210 303 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZP1P60852 638 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 MS4A2Q01362 244 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZBTB16Q05516 673 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPOCK1Q08629 439 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC14A1Q13336 389 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 EBI3Q14213 229 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIR2DS3Q14952 304 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF79Q15937 498 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 EFHC1Q5JVL4 640 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC35E4Q6ICL7 350 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 NFE4Q86UQ8 179 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADGRF4Q8IZF3 695 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 DMBX1Q8NFW5 382 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR13A1Q8NGR1 328 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 GRHL3Q8TE85 626 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 SSC4DQ8WTU2 575 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 GLG1Q92896 1179 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 EME1Q96AY2 570 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 HS6ST2Q96MM7 605 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 SOSTQ9BQB4 213 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 BOCQ9BWV1 1114 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 NUAK2Q9H093 628 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAP6D1Q9H9H5 199 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLAMF7Q9NQ25 335 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 LANCL2Q9NS86 450 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 TAAR2Q9P1P5 351 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 ASIC3Q9UHC3 531 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 AMFRQ9UKV5 643 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 MUC12Q9UKN1 5478 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 BLACEA4D250 179 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 RRHO14718 337 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZEB2O60315 1214 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGLV3-19P01714 112 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRB1P04280 392 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRIM49P0CI25 452 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRIM49CP0CI26 452 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCNA6P17658 529 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 GIPRP48546 466 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 PEX5P50542 639 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYBPHQ13203 477 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 MTA1Q13330 715 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 OLIG2Q13516 323 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPP2R5EQ16537 467 aa-0.7□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms