RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 RFWD3Q6PCD5 774 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 MYO1HQ8N1T3 1032 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 BTN2A2Q8WVV5 523 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 KLHL32Q96NJ5 620 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 EBF3Q9H4W6 596 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 EBF2Q9HAK2 575 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 KRT84Q9NSB2 600 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 LIMD1Q9UGP4 676 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 SLC12A4Q9UP95 1085 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 CARD8Q9Y2G2 431 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 EFCAB10A6NFE3 127 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 NADKO95544 446 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 TALDO1P37837 337 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 GP5P40197 560 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 MMP14P50281 582 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 GALNT18Q6P9A2 607 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 FBXL16Q8N461 479 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 PNMA5Q96PV4 448 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 PHF12Q96QT6 1004 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 SLC25A23Q9BV35 468 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 GPAMQ9HCL2 828 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 ARHGEF3Q9NR81 526 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 GIN1Q9NXP7 522 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 FAM53CQ9NYF3 392 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 USP18Q9UMW8 372 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 ABHD2P08910 425 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 PSME3P61289 254 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 SEZ6Q53EL9 994 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 CIAPIN1Q6FI81 312 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 ANO7Q6IWH7 933 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 CES3Q6UWW8 571 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 TMC7Q7Z402 723 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 SLC17A7Q9P2U7 560 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 QRICH2Q9H0J4 1663 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 GLI2P10070 1586 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 BTN3A3O00478 584 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 MAFGO15525 162 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 CCNKO75909 580 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 SLC5A3P53794 718 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 SLC15A2Q16348 729 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 C6orf183Q5T699 404 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 CACHD1Q5VU97 1274 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 SLC7A14Q8TBB6 771 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 MECRQ9BV79 373 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 PLA2G12BQ9BX93 195 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 COA1Q9GZY4 146 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 GPRC5CQ9NQ84 441 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 PRKAG3Q9UGI9 489 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 ANAPC2Q9UJX6 822 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 RNF112Q9ULX5 631 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 TM7SF2O76062 418 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 GJB6O95452 261 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 MPOP05164 745 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 CHRM3P20309 590 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 PEX2P28328 305 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 BTBD8Q5XKL5 378 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 FGD2Q7Z6J4 655 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 PIGWQ7Z7B1 504 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 HPS6Q86YV9 775 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 SNX31Q8N9S9 440 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 GLIS3Q8NEA6 775 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 RCN3Q96D15 328 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 NT5C1AQ9BXI3 368 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 PSMD13Q9UNM6 376 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 AXIN2Q9Y2T1 843 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 SNX8Q9Y5X2 465 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 ASNSP08243 561 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 RPL14P50914 215 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 RBP5P82980 135 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 PKN3Q6P5Z2 889 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 LINC00523Q86TU6 105 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 ITFG1Q8TB96 612 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 ASIC4Q96FT7 647 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 MED15Q96RN5 788 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 DUSP12Q9UNI6 340 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 TRIM38O00635 465 aa10.02□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 TPP1O14773 563 aa10.02□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 ARIH2O95376 493 aa10.02□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms