RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
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TRAPPC3-204ENST00000373166 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 ARID3AQ99856 593 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 GPR174Q9BXC1 333 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 ITM2CQ9NQX7 267 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
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TRAPPC3-204ENST00000373166 LOC400499M0QZD8 3231 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 NPC1O15118 1278 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 PLA2G4AP47712 749 aa20.11■□□□□ 0.81
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TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF394Q53GI3 561 aa20.11■□□□□ 0.81
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TRAPPC3-204ENST00000373166 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
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TRAPPC3-204ENST00000373166 CYFIP2Q96F07 1278 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 LMBRD1Q9NUN5 540 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
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TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF883P0CG24 379 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
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TRAPPC3-204ENST00000373166 TRIM59Q8IWR1 403 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 MDM1Q8TC05 714 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
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TRAPPC3-204ENST00000373166 TM7SF3Q9NS93 570 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 OSER1Q9NX31 292 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 PLK2Q9NYY3 685 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 DNMT3LQ9UJW3 386 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 FBXO10Q9UK96 956 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
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TRAPPC3-204ENST00000373166 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
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TRAPPC3-204ENST00000373166 LRMPQ12912 555 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 E2F5Q15329 346 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 DCAF12L1Q5VU92 463 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 UCMAQ8WVF2 138 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
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TRAPPC3-204ENST00000373166 TMEM176AQ96HP8 235 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 NT5C1BQ96P26 610 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 CDC6Q99741 560 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
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TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 RAXQ9Y2V3 346 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 MYH10P35580 1976 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 METTL12A8MUP2 240 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 CYP26A1O43174 497 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 AFPP02771 609 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 RARGP13631 454 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 TPMTP51580 245 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 RAD23BP54727 409 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 KCNH2Q12809 1159 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 C10orf120Q5SQS8 335 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 Q6ZNB5 142 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 CLEC20AQ6ZU45 233 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 TADA2BQ86TJ2 420 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMPRSS6Q8IU80 811 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
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TRAPPC3-204ENST00000373166 NUP58Q9BVL2 599 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 PNPLA8Q9NP80 782 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.81
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TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF510Q9Y2H8 683 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC3-204ENST00000373166 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-204ENST00000373166 KCNJ18B7U540 433 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-204ENST00000373166 MDM4O15151 490 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-204ENST00000373166 ACADMP11310 421 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-204ENST00000373166 ACO1P21399 889 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-204ENST00000373166 CHKAP35790 457 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-204ENST00000373166 IL12RB1P42701 662 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-204ENST00000373166 MFAP3P55082 362 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-204ENST00000373166 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-204ENST00000373166 HLA-BQ31612 363 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-204ENST00000373166 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-204ENST00000373166 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC4A11Q8NBS3 891 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-204ENST00000373166 RHBDD1Q8TEB9 315 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-204ENST00000373166 NMUR1Q9HB89 426 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-204ENST00000373166 SCUBE2Q9NQ36 999 aa20.07■□□□□ 0.8
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