RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 VPS52Q8N1B4 723 aa15.9■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 OR2W6PQ8NHA6 318 aa15.9■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 SPATA17Q96L03 361 aa15.9■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 SIK2Q9H0K1 926 aa15.9■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 DTLQ9NZJ0 730 aa15.9■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 OR12D3Q9UGF7 316 aa15.9■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 FAM92AA1XBS5 289 aa15.89■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 GOLGA6BA6NDN3 693 aa15.89■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 IRAK2O43187 625 aa15.89■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 ABLIM3O94929 683 aa15.89■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 GJB5O95377 273 aa15.89■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 GLUD2P49448 558 aa15.89■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP15.89■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 DPYSQ14117 519 aa15.89■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 CFAP58Q5T655 872 aa15.89■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 RFX8Q6ZV50 586 aa15.89■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF461Q8TAF7 563 aa15.89■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 LRRC45Q96CN5 670 aa15.89■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 SEMA4AQ9H3S1 761 aa15.89■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 SMOC2Q9H3U7 446 aa15.89■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa15.89■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 H3BRJ5 948 aa15.88■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 KCNN4O15554 427 aa15.88■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 LINC00271P0C7V0 271 aa15.88■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 SRGAP2BP0DMP2 458 aa15.88■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 RARGP13631 454 aa15.88■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 AIF1P55008 147 aa15.88■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 EFEMP1Q12805 493 aa15.88■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 ZBED2Q9BTP6 218 aa15.88■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa15.88■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 EPB41L4BQ9H329 900 aa15.88■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 PCDH9Q9HC56 1237 aa15.88■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa15.88■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 PLAAQ9Y263 795 aa15.88■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 DCLK1O15075 740 aa15.88■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 MFSD11O43934 449 aa15.88■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 SPATA31D3P0C874 917 aa15.88■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 CAPN2P17655 700 aa15.88■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 ERCC2P18074 760 aa15.88■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 OAS2P29728 719 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 PMS2P54278 862 aa15.88■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 GAD2Q05329 585 aa15.88■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 SYCP2LQ5T4T6 812 aa15.88■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 ALS2CLQ60I27 953 aa15.88■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa15.88■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 TRIM62Q9BVG3 475 aa15.88■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 CYP4F11Q9HBI6 524 aa15.88■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa15.87■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 LCHNA4D1U4 455 aa15.87■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 H0YGN5 161 aa15.87■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 PAGE1O75459 146 aa15.87■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 LRIG2O94898 1065 aa15.87■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 STIP1P31948 543 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 TUFMP49411 452 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 TPI1P60174 286 aa15.87■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 ANKRD22Q5VYY1 191 aa15.87■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 FIBCD1Q8N539 461 aa15.87■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 LGMNQ99538 433 aa15.87■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 CCSER2Q9H7U1 834 aa15.87■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa15.87■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 NFS1Q9Y697 457 aa15.87■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa15.87■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 SHROOM3Q8TF72 1996 aa15.87■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 KCNU1A8MYU2 1149 aa15.86■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 FGF18O76093 207 aa15.86■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 CSPG5O95196 566 aa15.86■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 NR2C2P49116 596 aa15.86■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 ARTNQ5T4W7 220 aa15.86■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 MIB1Q86YT6 1006 aa15.86■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 KLHL23Q8NBE8 558 aa15.86■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 CCHCR1Q8TD31 782 aa15.86■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 GOLGA8MH3BSY2 632 aa15.86■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 LILRB3O75022 631 aa15.86■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 URODP06132 367 aa15.86■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 HMBSP08397 361 aa15.86■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 CCR1P32246 355 aa15.86■□□□□ 0.13
CASQ1-201ENST00000368078 CA8P35219 290 aa15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms