RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367094.6

TULP4-201, Transcript of tubby like protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TULP4, Length 5,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4-201ENST00000367094 CRLS1Q9UJA2 301 aa10.46□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 TNFSF13BQ9Y275 285 aa10.46□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa10.46□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 SIGLEC16A6NMB1 481 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 CENPXA8MT69 81 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 H3BMM5 538 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 TRIM24O15164 1050 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 CHADO15335 359 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 PMPCBO75439 489 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 SERPINE1P05121 402 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 SNHG28P0DPA3 235 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 RXRGP48443 463 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 TKTL1P51854 596 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 OXCT1P55809 520 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 IL17AQ16552 155 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 CACHD1Q5VU97 1274 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 RFX8Q6ZV50 586 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 STRA8Q7Z7C7 330 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 C4orf32Q8N8J7 132 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 SNX31Q8N9S9 440 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 CYGBQ8WWM9 190 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 SOCS4Q8WXH5 440 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 VPS33AQ96AX1 596 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 MTERF3Q96E29 417 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 SAR1AQ9NR31 198 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 VANGL2Q9ULK5 521 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 MLNP12872 115 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 CHRM3P20309 590 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 CRABP2P29373 138 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 TM4SF1P30408 202 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 RRM2P31350 389 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 CCR1P32246 355 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 UBE3AQ05086 875 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 ENPEPQ07075 957 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 ARHGAP17Q68EM7 881 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 TMEM154Q6P9G4 183 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 WDR59Q6PJI9 974 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 HERC6Q8IVU3 1022 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 HTR3CQ8WXA8 447 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 SHC3Q92529 594 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 LRRC19Q9H756 370 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 LRRC74AQ0VAA2 488 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 LRP10Q7Z4F1 713 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 CYP4Z1Q86W10 505 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 OOSP2Q86WS3 158 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 ZNF333Q96JL9 665 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 RMND5AQ9H871 391 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 MYO1GB0I1T2 1018 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 NUDT2P50583 147 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 PRKAA1Q13131 559 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 PDPK2PQ6A1A2 396 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 POLNQ7Z5Q5 900 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 CCDC103Q8IW40 242 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 WNK4Q96J92 1243 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 HSD17B14Q9BPX1 270 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 USE1Q9NZ43 259 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 RNF112Q9ULX5 631 aa10.45□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 ANKRD63C9JTQ0 380 aa10.44□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 F8W810 466 aa10.44□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 RNF103O00237 685 aa10.44□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 PTPRAP18433 802 aa10.44□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 PPIL2Q13356 520 aa10.44□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 PRMT9Q6P2P2 845 aa10.44□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 MFSD7Q6UXD7 560 aa10.44□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 ARRDC4Q8NCT1 418 aa10.44□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa10.44□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 ADGRE3Q9BY15 652 aa10.44□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 ELOVL4Q9GZR5 314 aa10.44□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 PIGUQ9H490 435 aa10.44□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 THAP1Q9NVV9 213 aa10.44□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa10.44□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 TMCC3Q9ULS5 477 aa10.44□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa10.44□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 LACTBL1A8MY62 500 aa10.44□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 MAFO75444 373 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 CDH18Q13634 790 aa10.44□□□□□ -0.74
TULP4-201ENST00000367094 RASA2Q15283 850 aa10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms