RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366998.4

NEK2-201, Transcript of NIMA related kinase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK2, Length 1,865 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK2-201ENST00000366998 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 FAM182AQ5T1J6 154 aa15.49■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 ANKRD22Q5VYY1 191 aa15.49■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa15.49■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 NUDT5Q9UKK9 219 aa15.49■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 SNX10Q9Y5X0 201 aa15.49■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 CDY1Q9Y6F8 540 aa15.49■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 GREB1Q4ZG55 1949 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 TLDC2A0PJX2 215 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 TBC1D4O60343 1298 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 TTC4O95801 387 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 TIMP1P01033 207 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 CSF2RAP15509 400 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 RAG1P15918 1043 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 MAGEA4P43358 317 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 LBX1P52954 281 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 USP46P62068 366 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 DEFB103AP81534 67 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 SMARCB1Q12824 385 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 TERF2Q15554 542 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 USP41Q3LFD5 358 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 NECAB2Q7Z6G3 386 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 MON1AQ86VX9 555 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 NETO2Q8NC67 525 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 CASP10Q92851 521 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 RTP4Q96DX8 246 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 C9orf72Q96LT7 481 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 EPAS1Q99814 870 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 SMOC2Q9H3U7 446 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 GMIPQ9P107 970 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 COL4A6Q14031 1691 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 TRIM43BA6NCK2 446 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 MSI1O43347 362 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 IGLV3-25P01717 112 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 ERCC2P18074 760 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 ITGB8P26012 769 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 SEMA3BQ13214 749 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 PSMD5Q16401 504 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 HIF1AQ16665 826 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 KIAA1841Q6NSI8 718 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 CENPUQ71F23 418 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 ARHGAP18Q8N392 663 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 NAT8LQ8N9F0 302 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 FBXO22Q8NEZ5 403 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 FBXO32Q969P5 355 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 TOP1MTQ969P6 601 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 IGSF21Q96ID5 467 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 PRDM10Q9NQV6 1147 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 RAB6BQ9NRW1 208 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 PCDH10Q9P2E7 1040 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 OR12D3Q9UGF7 316 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa15.47■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 HACD1B0YJ81 288 aa15.47■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 C2CD2LO14523 706 aa15.47■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 DCLK1O15075 740 aa15.47■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 RPL17P18621 184 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 YWHAQP27348 245 aa15.47■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 ARL4CP56559 192 aa15.47■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 GAD2Q05329 585 aa15.47■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 DUSP4Q13115 394 aa15.47■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 BRMS1LQ5PSV4 323 aa15.47■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 AGBL2Q5U5Z8 902 aa15.47■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 CCDC110Q8TBZ0 833 aa15.47■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 OLFM3Q96PB7 478 aa15.47■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 SIK2Q9H0K1 926 aa15.47■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 CRISPLD1Q9H336 500 aa15.47■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 OSER1Q9NX31 292 aa15.47■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 SMAPO00193 183 aa15.46■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 TMEM63AO94886 807 aa15.46■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 VNN2O95498 520 aa15.46■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 ACRP10323 421 aa15.46■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 CCR1P32246 355 aa15.46■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 C1QTNF8P60827 252 aa15.46■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 AP1B1Q10567 949 aa15.46■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 PDK1Q15118 436 aa15.46■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 SYCP2LQ5T4T6 812 aa15.46■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 FAXCQ5TGI0 409 aa15.46■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 RELL1Q8IUW5 271 aa15.46■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 ZBED8Q8IZ13 594 aa15.46■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa15.46■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 CCNYQ8ND76 341 aa15.46■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
NEK2-201ENST00000366998 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms