RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 KAT5Q92993 513 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF558Q96NG5 402 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 MAF1Q9H063 256 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 SEMA4AQ9H3S1 761 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 IL1RL2Q9HB29 575 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 MYO1GB0I1T2 1018 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNK1O00180 336 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 GRK3P35626 688 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 CSHL1Q14406 222 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 DMC1Q14565 340 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRC38Q5VT99 294 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 MOB2Q70IA6 237 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 HEY2Q9UBP5 337 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 SEPT3Q9UH03 358 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 DYRK1BQ9Y463 629 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 IGSF6O95976 241 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 SLURP2P0DP57 97 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 SNHG28P0DPA3 235 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 BMT2Q1RMZ1 405 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM71AQ8IYT1 594 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 EFCAB1Q9HAE3 211 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM153AQ9UHL3 310 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 SUFUQ9UMX1 484 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 EPB42P16452 691 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 PGAM1P18669 254 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM110CQ1W6H9 321 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 ZACNQ401N2 412 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 STX19Q8N4C7 294 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 SHC3Q92529 594 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 OTULINQ96BN8 352 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 CYP4F12Q9HCS2 524 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNA4P22459 653 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 RPL9P32969 192 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 NUDT2P50583 147 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 CEP70Q8NHQ1 597 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 PLEKHA8Q96JA3 519 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 ADNPQ9H2P0 1102 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 WDR41Q9HAD4 459 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 TBC1D4O60343 1298 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 TSPAN3O60637 253 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 MPOP05164 745 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 NCKAP1LP55160 1127 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRC8BQ6P9F7 803 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 DSG4Q86SJ6 1040 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 TSPAN18Q96SJ8 248 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 PRIM2P49643 509 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 CYTH1Q15438 398 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 SPANXN3Q5MJ09 141 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC149Q6ZUS6 474 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 PHACTR4Q8IZ21 702 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 RMND5AQ9H871 391 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 F8VP50 259 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 CCND1P24385 295 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 BTKQ06187 659 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 FUT2Q10981 343 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 NOMO2Q5JPE7 1267 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 HYIQ5T013 277 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 ICE2Q659A1 982 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 PDPK2PQ6A1A2 396 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRC39Q96DD0 335 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 CEP41Q9BYV8 373 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 EFCAB14O75071 495 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 CPA2P48052 419 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 NUMBP49757 651 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 HORMAD1Q86X24 394 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM136AQ96C01 138 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 DNPEPQ9ULA0 475 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 DTNAQ9Y4J8 743 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 HES2Q9Y543 173 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 NR2E3Q9Y5X4 410 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 RIPK2O43353 540 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 ACADMP11310 421 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 PSEN1P49768 467 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 CNTN1Q12860 1018 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 BMPR2Q13873 1038 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 ITIH4Q14624 930 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4-201ENST00000344528 DUSP28Q4G0W2 176 aa16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms