RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 UNC45BQ8IWX7 931 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNV2Q8TDN2 545 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 DDI1Q8WTU0 396 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 RUBCNQ92622 972 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC2A13Q96QE2 648 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERGIC2Q96RQ1 377 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 EBF1Q9UH73 591 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 IRAK2O43187 625 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACSL4O60488 711 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSF2BPO75031 334 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 GFPT2O94808 682 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 GLI1P08151 1106 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC6A4P31645 630 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 SOX5P35711 763 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 SGSHP51688 502 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 LPAL2Q16609 132 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 NADSYN1Q6IA69 706 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR6B2Q6IFH4 312 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 RASSF3Q86WH2 238 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 DEFB106AQ8N104 65 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM35BQ8NCS4 154 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC20A1Q8WUM9 679 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 GAB3Q8WWW8 586 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 AZIN2Q96A70 460 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDCL3Q9H2J4 239 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 CFAP54Q96N23 3096 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYCE3A1L190 88 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRAP2O75791 330 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 LSM8O95777 96 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 MMEP08473 750 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC11A2P49281 568 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF165P49910 485 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 DGKEP52429 567 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 GEN1Q17RS7 908 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 EFHC1Q5JVL4 640 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF43Q68DV7 783 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANO7Q6IWH7 933 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 RFWD3Q6PCD5 774 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC26A9Q7LBE3 791 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 DCLK2Q8N568 766 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 NEK11Q8NG66 645 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACOX2Q99424 681 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYNCQ9H7C4 482 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 NCDNQ9UBB6 729 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 FRYLO94915 3013 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM170AA1A519 330 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMTNL1A8MU46 457 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 DAB1O75553 588 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPP40O75818 363 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 GABRB2P47870 512 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNX16P57768 344 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 NOMO3P69849 1222 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC6A3Q01959 620 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 IQCB1Q15051 598 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 DCAF6Q58WW2 860 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 LAIR1Q6GTX8 287 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 CEP68Q76N32 757 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF677Q86XU0 584 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 MDGA1Q8NFP4 955 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPAG5Q96R06 1193 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 HINFPQ9BQA5 517 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC2A11Q9BYW1 496 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 TPSD1Q9BZJ3 242 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM204AQ9H8W3 233 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB23Q9ULC3 237 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 HOXB2P14652 356 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHRNB2P17787 502 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 NTSR1P30989 418 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 STAT1P42224 750 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 WASP42768 502 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDR2Q01850 454 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIK3R6Q5UE93 754 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYEOVQ96EZ4 313 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 SDK1Q7Z5N4 2213 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 TEX33O43247 280 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 APOEP02649 317 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTMSP20962 102 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDK17Q00537 523 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 FMO1Q01740 532 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms