RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317338.16

SEZ6-201, Transcript of seizure related 6 homolog, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEZ6, Length 4,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEZ6-201ENST00000317338 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa14.96□□□□□ -0.01
SEZ6-201ENST00000317338 OMDQ99983 421 aa14.96□□□□□ -0.01
SEZ6-201ENST00000317338 CENPKQ9BS16 269 aa14.96□□□□□ -0.01
SEZ6-201ENST00000317338 TM6SF2Q9BZW4 377 aa14.96□□□□□ -0.01
SEZ6-201ENST00000317338 IL23AQ9NPF7 189 aa14.96□□□□□ -0.01
SEZ6-201ENST00000317338 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa14.96□□□□□ -0.01
SEZ6-201ENST00000317338 FRMD3A2A2Y4 597 aa14.96□□□□□ -0.01
SEZ6-201ENST00000317338 SERPIND1P05546 499 aa14.96□□□□□ -0.01
SEZ6-201ENST00000317338 ATP4AP20648 1035 aa14.96□□□□□ -0.01
SEZ6-201ENST00000317338 KYNUQ16719 465 aa14.96□□□□□ -0.01
SEZ6-201ENST00000317338 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SEZ6-201ENST00000317338 SLC9A7Q96T83 725 aa14.96□□□□□ -0.01
SEZ6-201ENST00000317338 ZYG11BQ9C0D3 744 aa14.96□□□□□ -0.01
SEZ6-201ENST00000317338 MCOLN1Q9GZU1 580 aa14.96□□□□□ -0.01
SEZ6-201ENST00000317338 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa14.96□□□□□ -0.01
SEZ6-201ENST00000317338 BRAFP15056 766 aa14.96□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 CLCN6P51797 869 aa14.96□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 REXO1L1PQ8IX06 675 aa14.96□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 DMAC2Q9NW81 257 aa14.96□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 AP5Z1O43299 807 aa14.95□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 CTIFO43310 598 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 RHOBTB1O94844 696 aa14.95□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 LMO2P25791 158 aa14.95□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 SLC11A1P49279 550 aa14.95□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 TTLL9Q3SXZ7 439 aa14.95□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa14.95□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 PIGRP01833 764 aa14.95□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 GLI1P08151 1106 aa14.95□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 MAGEA4P43358 317 aa14.95□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 BCAS4Q8TDM0 211 aa14.95□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 BRD8Q9H0E9 1235 aa14.95□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 UBR2Q8IWV8 1755 aa14.95□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 FGF18O76093 207 aa14.95□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 CCNG2Q16589 344 aa14.95□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 TBC1D19Q8N5T2 526 aa14.95□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 RASSF2P50749 326 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 HTR3CQ8WXA8 447 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 NFKBIZQ9BYH8 718 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 BAG5Q9UL15 447 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 RAB23Q9ULC3 237 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 GOLGA8RI6L899 631 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 PITPNM1O00562 1244 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 ATP8B1O43520 1251 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 SOAT2O75908 522 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 SUN1O94901 812 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 SERPINA4P29622 427 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 CRLF3Q8IUI8 442 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 POF1BQ8WVV4 589 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 KAT2BQ92831 832 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 SDR42E2A6NKP2 422 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 MSI1O43347 362 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 KDM1AO60341 852 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 SPAG6O75602 509 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 IL1BP01584 269 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 NR1D1P20393 614 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 MMP13P45452 471 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 GATMP50440 423 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 RAD23BP54727 409 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 RCN2Q14257 317 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 PTPN20Q4JDL3 420 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 ZCWPW2Q504Y3 356 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 TPGS2Q68CL5 300 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 SZRD1Q7Z422 152 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 NT5DC3Q86UY8 548 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 SHISA4Q96DD7 197 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 TMEM175Q9BSA9 504 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 DPEP3Q9H4B8 488 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 MLXIPLQ9NP71 852 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 SQORQ9Y6N5 450 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 HEATR9A2RTY3 570 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 NFATC1O95644 943 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 MEA1Q16626 185 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 ARMC12Q5T9G4 340 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 TTC7BQ86TV6 843 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 BAP1Q92560 729 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 ZFP14Q9HCL3 533 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 FBXO10Q9UK96 956 aa14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SEZ6-201ENST00000317338 PER2O15055 1255 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms