RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 PIK3CAP42336 1068 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 NAMPTP43490 491 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PEX5P50542 639 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 SCNN1GP51170 649 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 EFNA5P52803 228 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 WDR4P57081 412 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF844Q08AG5 666 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PTP4A2Q12974 167 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 EMC2Q15006 297 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC5A9Q2M3M2 681 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 MTERF2Q49AM1 385 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 SGO2Q562F6 1265 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 NAA35Q5VZE5 725 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PLA2G4FQ68DD2 849 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF43Q68DV7 783 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 TANGO2Q6ICL3 276 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 FUT10Q6P4F1 479 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 C19orf48Q6RUI8 117 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 Q6ZS52 159 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC121Q6ZUS5 278 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ANO5Q75V66 913 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 SV2AQ7L0J3 742 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 LONP2Q86WA8 852 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
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SMARCE1-201ENST00000264640 CBWD2Q8IUF1 395 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 SH2D3CQ8N5H7 860 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 OLIG1Q8TAK6 271 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC7A14Q8TBB6 771 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 HASPINQ8TF76 798 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC7A3Q8WY07 619 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM3CQ92520 227 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 SLCO2A1Q92959 643 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CD101Q93033 1021 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 SAAL1Q96ER3 474 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PGM2Q96G03 612 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 KREMEN1Q96MU8 473 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CCT8L2Q96SF2 557 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 GAD1Q99259 594 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PLCD4Q9BRC7 762 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM51Q9BSJ1 452 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 SCNM1Q9BWG6 230 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM31Q9BZY9 425 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 IKZF4Q9H2S9 585 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC19Q9H756 370 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 BRD9Q9H8M2 597 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CHST7Q9NS84 486 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 NFS1Q9Y697 457 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PIAS3Q9Y6X2 628 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIP11Q15643 1979 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 LAMA5O15230 3695 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 MYO16Q9Y6X6 1858 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 THADAQ6YHU6 1953 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 H0YHG0 523 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 K7ERI5 159 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 K7ESF4 209 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ADAM12O43184 909 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ECI2O75521 394 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 HLA-DRAP01903 254 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF806P0C7X5 589 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CEBPBP17676 345 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ADSSP30520 456 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PTGIRP43119 386 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PXNP49023 591 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CLDN10P78369 228 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 DSC1Q08554 894 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 RTP2Q5QGT7 225 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 UBXN11Q5T124 520 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 DCAF12L1Q5VU92 463 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 LYPD8Q6UX82 237 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CPLX4Q7Z7G2 160 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 KBTBD6Q86V97 674 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC47A2Q86VL8 602 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 RHOT1Q8IXI2 618 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 MCOLN2Q8IZK6 566 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKS4BQ8N8V4 417 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PRELID2Q8N945 189 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ATL2Q8NHH9 583 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PLEKHO2Q8TD55 490 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 TAS1R2Q8TE23 839 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 TCP11Q8WWU5 503 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ALG3Q92685 438 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 SEMA4DQ92854 862 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ZBTB9Q96C00 473 aa7.35□□□□□ -1.23
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