RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261427.9

UBE2K-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 K, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2K, Length 5,245 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2K-201ENST00000261427 SNX13Q9Y5W8 968 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 TNS2Q63HR2 1409 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 NR5A2O00482 541 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 SERPINB3P29508 390 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 OR1E1P30953 314 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 TUBP50607 506 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 RASA2Q15283 850 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 IQSEC1Q6DN90 963 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 PIK3C2BO00750 1634 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 MICAL2O94851 1124 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 HMGCRP04035 888 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 CYP3A4P08684 503 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 PCNAP12004 261 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 DCCP43146 1447 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 NT5DC1Q5TFE4 455 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 TMEM86AQ8N2M4 240 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 VTI1BQ9UEU0 232 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 PTPN3P26045 913 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 PLCL1Q15111 1095 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 NR6A1Q15406 480 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 TMEM159Q96B96 161 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 NMRAL1Q9HBL8 299 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 TRPV2Q9Y5S1 764 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 WNT10BO00744 389 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 RAD51BO15315 384 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 ADORA2AP29274 412 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 PSEN2P49810 448 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 RAD23AP54725 363 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 SLC6A3Q01959 620 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 POU6F1Q14863 301 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 FAM171A1Q5VUB5 890 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 PDPK2PQ6A1A2 396 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 DEFB128Q7Z7B8 93 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 PARVBQ9HBI1 364 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 MIEF1Q9NQG6 463 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 UBP1Q9NZI7 540 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 PPP2R1BP30154 601 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 SERPINB1P30740 379 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 NAB1Q13506 487 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 CYB5D1Q6P9G0 228 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 GPC2Q8N158 579 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 CNBD2Q96M20 576 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 BBS2Q9BXC9 721 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 KLHL28Q9NXS3 571 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 PADI4Q9UM07 663 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 STARD13Q9Y3M8 1113 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 FKBP6O75344 327 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 SERPINE1P05121 402 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 PYGMP11217 842 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 RFX3P48380 749 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 MTSS1LQ765P7 747 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 FAM136AQ96C01 138 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 EPS8L2Q9H6S3 715 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 DCLRE1BQ9H816 532 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 VPS51Q9UID3 782 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 PSMC3P17980 439 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 BGNP21810 368 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 AKAP5P24588 427 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 TAS2R13Q9NYV9 303 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 ELK3P41970 407 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 NT5DC3Q86UY8 548 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 KCNMB4Q86W47 210 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 CYP2W1Q8TAV3 490 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 OSBPL10Q9BXB5 764 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 RGS18Q9NS28 235 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 LACTBL1A8MY62 500 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 BMP10O95393 424 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 GHRP10912 638 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 BMPR2Q13873 1038 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 ARHGEF19Q8IW93 802 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 ZNF614Q8N883 585 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 CPNE1Q99829 537 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 SIKE1Q9BRV8 207 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 E9PBE3 544 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 KLHL41O60662 606 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2K-201ENST00000261427 IGSF6O95976 241 aa20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms