RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259983.7

C6orf52-201, Transcript of chromosome 6 open reading frame 52, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene C6orf52, Length 619 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf52-201ENST00000259983 IGLV3-27P01718 113 aa14.86□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 CD44P16070 742 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 CD6P30203 668 aa14.86□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 GCNT1Q02742 428 aa14.86□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 CETN1Q12798 172 aa14.86□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 ZNF234Q14588 700 aa14.86□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 ADGRF1Q5T601 910 aa14.86□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 TMEM270Q6UE05 265 aa14.86□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 TRIML1Q8N9V2 468 aa14.86□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 UBA3Q8TBC4 463 aa14.86□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 DDI1Q8WTU0 396 aa14.86□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 TFAP2BQ92481 460 aa14.86□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 HSFY1Q96LI6 401 aa14.86□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 HSPA12BQ96MM6 686 aa14.86□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa14.86□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 ITM2CQ9NQX7 267 aa14.86□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 SUSD2Q9UGT4 822 aa14.86□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 MAN1B1Q9UKM7 699 aa14.86□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 CLEC4EQ9ULY5 219 aa14.86□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa14.86□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 CHD6Q8TD26 2715 aa14.85□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 BICDL2A1A5D9 508 aa14.85□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 ARHGAP33O14559 1287 aa14.85□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 NDUFS2O75306 463 aa14.85□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 GABBR2O75899 941 aa14.85□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 CFIP05156 583 aa14.85□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 NCAM1P13591 858 aa14.85□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 BMP6P22004 513 aa14.85□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 MAPK8P45983 427 aa14.85□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 MARSP56192 900 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 RING1Q06587 406 aa14.85□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 LRMPQ12912 555 aa14.85□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 UAP1L1Q3KQV9 507 aa14.85□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 MPP7Q5T2T1 576 aa14.85□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 SYCP2LQ5T4T6 812 aa14.85□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 TMEM215Q68D42 235 aa14.85□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 CADM4Q8NFZ8 388 aa14.85□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa14.85□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 DNASE2BQ8WZ79 361 aa14.85□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 ZSWIM1Q9BR11 485 aa14.85□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 SLC6A17Q9H1V8 727 aa14.85□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 SLC32A1Q9H598 525 aa14.85□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 CD93Q9NPY3 652 aa14.85□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa14.84□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa14.84□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 KRT37O76014 449 aa14.84□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 FBXO21O94952 628 aa14.84□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 GNA14O95837 355 aa14.84□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 SYPP08247 313 aa14.84□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 HLA-FP30511 346 aa14.84□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 OXTRP30559 389 aa14.84□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 RPL34P49207 117 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 COPAP53621 1224 aa14.84□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 MORC3Q14149 939 aa14.84□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 MEA1Q16626 185 aa14.84□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 CCDC40Q4G0X9 1142 aa14.84□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 WDR45BQ5MNZ6 344 aa14.84□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 PMF1Q6P1K2 205 aa14.84□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 TMPRSS6Q8IU80 811 aa14.84□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 TRIM59Q8IWR1 403 aa14.84□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 PPM1KQ8N3J5 372 aa14.84□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 DEFB119Q8N690 84 aa14.84□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 DEFB124Q8NES8 71 aa14.84□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 EDEM1Q92611 657 aa14.84□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 AZIN2Q96A70 460 aa14.84□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 PCED1AQ9H1Q7 454 aa14.84□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa14.84□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 CNTN6Q9UQ52 1028 aa14.84□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa14.84□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 FRYQ5TBA9 3013 aa14.84□□□□□ -0.03
C6orf52-201ENST00000259983 NUMA1Q14980 2115 aa14.83□□□□□ -0.04
C6orf52-201ENST00000259983 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
C6orf52-201ENST00000259983 IRAK2O43187 625 aa14.83□□□□□ -0.04
C6orf52-201ENST00000259983 OPHN1O60890 802 aa14.83□□□□□ -0.04
C6orf52-201ENST00000259983 GJB3O75712 270 aa14.83□□□□□ -0.04
C6orf52-201ENST00000259983 GNSP15586 552 aa14.83□□□□□ -0.04
C6orf52-201ENST00000259983 PRKCHP24723 683 aa14.83□□□□□ -0.04
C6orf52-201ENST00000259983 TPMTP51580 245 aa14.83□□□□□ -0.04
C6orf52-201ENST00000259983 SLC14A1Q13336 389 aa14.83□□□□□ -0.04
C6orf52-201ENST00000259983 NNTQ13423 1086 aa14.83□□□□□ -0.04
C6orf52-201ENST00000259983 NUGGCQ68CJ6 796 aa14.83□□□□□ -0.04
C6orf52-201ENST00000259983 UNC45BQ8IWX7 931 aa14.83□□□□□ -0.04
C6orf52-201ENST00000259983 HDDC3Q8N4P3 179 aa14.83□□□□□ -0.04
C6orf52-201ENST00000259983 MINDY1Q8N5J2 469 aa14.83□□□□□ -0.04
C6orf52-201ENST00000259983 NELFBQ8WX92 580 aa14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms