RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 GKN1Q9NS71 199 aa20.25■□□□□ 0.83
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HOXD11-201ENST00000249504 DUSP12Q9UNI6 340 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD11-201ENST00000249504 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
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HOXD11-201ENST00000249504 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD11-201ENST00000249504 IRAK2O43187 625 aa20.24■□□□□ 0.83
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HOXD11-201ENST00000249504 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa20.24■□□□□ 0.83
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HOXD11-201ENST00000249504 FAM204AQ9H8W3 233 aa20.24■□□□□ 0.83
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HOXD11-201ENST00000249504 TMEM51Q9NW97 253 aa20.23■□□□□ 0.83
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HOXD11-201ENST00000249504 ZFYVE19Q96K21 471 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXD11-201ENST00000249504 ALS2CR12Q96Q35 445 aa20.22■□□□□ 0.83
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HOXD11-201ENST00000249504 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
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HOXD11-201ENST00000249504 SLC39A13Q96H72 371 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXD11-201ENST00000249504 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
HOXD11-201ENST00000249504 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
HOXD11-201ENST00000249504 COX16Q9P0S2 106 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXD11-201ENST00000249504 WNT6Q9Y6F9 365 aa20.22■□□□□ 0.83
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HOXD11-201ENST00000249504 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
HOXD11-201ENST00000249504 DCXO43602 365 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD11-201ENST00000249504 STC2O76061 302 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD11-201ENST00000249504 IGLV3-27P01718 113 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD11-201ENST00000249504 MIPP30301 263 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD11-201ENST00000249504 CXCR3P49682 368 aa20.21■□□□□ 0.83
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HOXD11-201ENST00000249504 PFKPQ01813 784 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD11-201ENST00000249504 KIAA1958Q8N8K9 716 aa20.21■□□□□ 0.83
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HOXD11-201ENST00000249504 OSCP1Q8WVF1 389 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD11-201ENST00000249504 WDR24Q96S15 920 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD11-201ENST00000249504 DCLK3Q9C098 648 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD11-201ENST00000249504 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD11-201ENST00000249504 TBC1D14Q9P2M4 693 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD11-201ENST00000249504 HYOU1Q9Y4L1 999 aa20.21■□□□□ 0.83
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HOXD11-201ENST00000249504 PPP2R5DQ14738 602 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 PDGFRLQ15198 375 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 NT5DC3Q86UY8 548 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 SLC35F6Q8N357 371 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 DNASE1L2Q92874 299 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 WBP2Q969T9 261 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 ASIC4Q96FT7 647 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 FBXL21Q9UKT6 434 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 CTAGE9A4FU28 777 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 SPOPO43791 374 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 ALADP13716 330 aa20.19■□□□□ 0.82
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