RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 PIGWQ7Z7B1 504 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 SPATA13Q96N96 652 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 PAFAH2Q99487 392 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 MAGEB5Q9BZ81 275 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM30AQ9NV96 361 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 PCDHB8Q9UN66 801 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 CHMP2BQ9UQN3 213 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 USP17L7P0C7H9 530 aa23.64■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 NCAM1P13591 858 aa23.64■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 MSH2P43246 934 aa23.64■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 FAM189BP81408 668 aa23.64■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 MPP2Q14168 576 aa23.64■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 TRAF7Q6Q0C0 670 aa23.64■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 LRRC34Q8IZ02 419 aa23.64■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 MAGEB18Q96M61 343 aa23.64■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 DCLK1O15075 740 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 MFSD11O43934 449 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 OPHN1O60890 802 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 APRTP07741 180 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 SARNPP82979 210 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 ITIH4Q14624 930 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 ANKS4BQ8N8V4 417 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 RAET1EQ8TD07 263 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 CABS1Q96KC9 395 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 BRD8Q9H0E9 1235 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM51Q9NW97 253 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 SAMD15Q9P1V8 674 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 KBTBD13C9JR72 458 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 NCAM2O15394 837 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 MAP3K6O95382 1288 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 COL6A1P12109 1028 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 MLNP12872 115 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 IFNAR2P48551 515 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 IL9RQ01113 521 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 C4orf50Q6ZRC1 276 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 ANKRD42Q8N9B4 389 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 CCDC197Q8NCU1 140 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 FTHL17Q9BXU8 183 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 KANSL3Q9P2N6 904 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 I3L4J1 428 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 VIMP08670 466 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 CXCR3P49682 368 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 DSC1Q08554 894 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 IGDCC3Q8IVU1 814 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 URGCPQ8TCY9 931 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 CD99L2Q8TCZ2 262 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 DENND1AQ8TEH3 1009 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 DCAKDQ8WVC6 231 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 COLEC11Q9BWP8 271 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 CREB3O43889 395 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 METTL18O95568 372 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 BDNFP23560 247 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 LRRC14Q15048 493 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 OR10T2Q8NGX3 314 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 MGARPQ8TDB4 240 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 SLC44A1Q8WWI5 657 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 DDIT4Q9NX09 232 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 FRMPD3Q5JV73 1810 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 VAV1P15498 845 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 CYP2C18P33260 490 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 CNPY4Q8N129 248 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 OTUD6BQ8N6M0 293 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 COX16Q9P0S2 106 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 FOXO6A8MYZ6 492 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 TYROBPO43914 113 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 ASMTLO95671 621 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 TPI1P60174 286 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP23.6■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 SPARCL1Q14515 664 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 BSPRYQ5W0U4 402 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 MZB1Q8WU39 189 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 APBB2Q92870 758 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF180Q9UJW8 692 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 IKBKGQ9Y6K9 419 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
HOXD9-201ENST00000249499 A0A1W2PQY0 241 aa23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.6 ms