RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000214095.1

Ubp1-204, Transcript of Upstream-binding protein 1, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubp1, Length 2,320 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm5689F6Y2A6 97 aa23.25■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Trdmt1O55055 415 aa23.25■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Acot1O55137 419 aa23.25■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cyp2f2P33267 491 aa23.25■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Arl4aP61213 200 aa23.25■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Sparcl1P70663 650 aa23.25■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Klra8Q60682 266 aa23.25■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tmem74Q8BQU7 305 aa23.25■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Washc5Q8C2E7 1159 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Syne4Q8CII8 388 aa23.25■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Celf3Q8CIN6 465 aa23.25■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Arhgap18Q8K0Q5 663 aa23.25■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fubp1Q91WJ8 651 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ier5lQ99J55 406 aa23.25■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 PiggD3Z3Y1 983 aa23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm20721E9Q2U8 318 aa23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Vmn1r39G3UWE6 305 aa23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm3187M0QWW3 260 aa23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Lmo2P25801 158 aa23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rpl10aP53026 217 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Emilin3P59900 758 aa23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 PrkcqQ02111 707 aa23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Btg1-ps1Q3V0S2 161 aa23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Btg1-ps2Q3V0X0 161 aa23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 AcdQ5EE38 416 aa23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mea1Q64327 174 aa23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fzd10Q8BKG4 582 aa23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pacs1Q8K212 961 aa23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ace2Q8R0I0 805 aa23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Traf7Q922B6 594 aa23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Noxred1Q9D3S5 366 aa23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tomm20lQ9D4V6 152 aa23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mettl7bQ9DD20 244 aa23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 PolhQ9JJN0 694 aa23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Neu2Q9JMH3 379 aa23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Kcnj6P48542 425 aa23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Smad1P70340 465 aa23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nfe2Q07279 373 aa23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pecam1Q08481 727 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Hsdl2Q2TPA8 490 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Stt3bQ3TDQ1 823 aa23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Otol1Q4ZJM7 482 aa23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rxfp1Q6R6I7 758 aa23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Lrrc24Q8BHA1 521 aa23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fbxw8Q8BIA4 598 aa23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mgrn1Q9D074 532 aa23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Znf687Q9D2D7 1237 aa23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Actrt2Q9D9L5 377 aa23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Acox2Q9QXD1 681 aa23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 S1pr4Q9Z0L1 386 aa23.24■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Serpinb3cA2RSF9 386 aa23.23■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Axin1O35625 863 aa23.23■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Btg3P50615 252 aa23.23■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 RnaselQ05921 735 aa23.23■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Htr1aQ64264 421 aa23.23■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pyhin1Q8BV49 420 aa23.23■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Abhd8Q8R0P8 439 aa23.23■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Myoz3Q8R4E4 245 aa23.23■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Actrt1Q9D9J3 376 aa23.23■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slc12a4Q9JIS8 1085 aa23.23■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pdpk1Q9Z2A0 559 aa23.23■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 B020004C17RikJ3QP07 232 aa23.22■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Sept7O55131 436 aa23.22■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Etaa1Q5SVT3 877 aa23.22■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Adgre1Q61549 931 aa23.22■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Armc12Q80X86 340 aa23.22■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fam49aQ8BHZ0 323 aa23.22■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Agbl2Q8CDK2 862 aa23.22■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ccdc63Q8CDV6 558 aa23.22■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Dedd2Q8QZV0 330 aa23.22■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ndufa10Q99LC3 355 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rsph3bQ9DA80 389 aa23.22■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rassf7Q9DD19 359 aa23.22■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Kdelc1Q9JHP7 502 aa23.22■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Trpm5Q9JJH7 1158 aa23.22■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cpxm1Q9Z100 722 aa23.22■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 DgkdE9PUQ8 1220 aa23.22■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rbm20Q3UQS8 1199 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slc5a10Q5SWY8 596 aa23.22■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Wee2Q66JT0 555 aa23.22■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Arhgef33Q8BW86 850 aa23.22■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Glra3Q91XP5 464 aa23.22■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ophn1Q99J31 802 aa23.22■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Lrrc71Q9D3W5 558 aa23.22■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slc23a1Q9Z2J0 605 aa23.22■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ces1bD3Z5G7 567 aa23.21■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pdzd7E9Q9W7 1021 aa23.21■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 CblP22682 913 aa23.21■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Atp5bP56480 529 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfm3P63056 478 aa23.21■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Yy1Q00899 414 aa23.21■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zfp658Q5PPQ4 887 aa23.21■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Itih3Q61704 889 aa23.21■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Stk40Q7TNL3 435 aa23.21■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pcdha1Q91Y21 948 aa23.21■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ttll8A4Q9F1 832 aa23.21■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr600E9PUN7 314 aa23.21■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 2010300C02RikE9Q3M9 1175 aa23.21■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Crabp2P22935 138 aa23.21■■□□□ 1.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 E330034G19RikQ3UWX6 351 aa23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.4 ms