RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TshrP47750 764 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CenpcP49452 906 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdh9P70407 786 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dab2P98078 766 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q3TTJ4 293 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Usp30Q3UN04 517 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tra2aQ6PFR5 281 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc39a4Q78IQ7 660 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tas2r134Q7TQB0 298 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1198Q7TR12 308 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mei4Q8BRM6 389 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dnm3Q8BZ98 863 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q8BZJ8 459 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc9b1Q8C0X2 565 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ago1Q8CJG1 857 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AagabQ8R2R3 316 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Luzp1Q8R4U7 1068 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Epn3Q91W69 636 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ttc1Q91Z38 292 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cmtm8Q9CZR4 173 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Grtp1Q9D3N8 359 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MesdQ9ERE7 224 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf354bQ9QXT9 601 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpc1Q9QZF2 557 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cpxm1Q9Z100 722 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Eif2ak3Q9Z2B5 1114 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rpl9-ps1S4R1R7 191 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Abca7Q91V24 2159 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TprnA2AI08 749 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ttc17E9PVB5 1198 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp266E9Q2S7 604 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr552E9Q545 317 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Farp1F8VPU2 1048 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ColqO35348 457 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wsb2O54929 404 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pgrmc1O55022 195 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sypl2O89104 264 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CkmP07310 381 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ZfxP17012 799 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CstaP56567 97 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 E2f2P56931 443 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pebp1P70296 187 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SlmapQ3URD3 845 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp235Q499D5 702 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PterQ60866 349 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Snx31Q6P8Y7 439 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ankzf1Q80UU1 748 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm5622Q810Q0 167 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 C8bQ8BH35 589 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Anks1bQ8BIZ1 1259 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam43aQ8BUP8 424 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cep95Q8BVV7 827 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pcyox1lQ8C7K6 495 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nlrp10Q8CCN1 673 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pym1Q8CHP5 203 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tram1l1Q8QZR0 363 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 HnrnplQ8R081 586 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ubap2Q91VX2 1132 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sntg2Q925E0 539 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ola1Q9CZ30 396 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pdk2Q9JK42 407 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Shroom3Q9QXN0 1986 aa11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 0610012G03RikA0A0J9YTR2 95 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rpl9-ps6A0A140T8T4 192 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm45261A0A1B0GSP6 197 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atp8b4A2ANX3 1194 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nhsl2B1AXH1 854 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Apba1B2RUJ5 842 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pgbd5D3YZI9 523 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Impa1O55023 277 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Grik2P39087 908 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cetn1P41209 172 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rpl9P51410 192 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CebpzP53569 1052 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TankP70347 448 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pi4k2aQ2TBE6 479 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 VwceQ3U515 929 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q3UZV7 1028 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rap1gap2Q5SVL6 712 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mapk6Q61532 720 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Six2Q62232 296 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Polr3gQ6NXY9 223 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fmnl3Q6ZPF4 1028 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TifaQ793I8 184 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slitrk6Q8C110 840 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rsad2Q8CBB9 362 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q8CD60 292 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arhgap18Q8K0Q5 663 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Scrn2Q8VCA8 425 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ubxn4Q8VCH8 506 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cox16Q9CR63 106 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Raver1Q9CW46 748 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam187aQ9D3R5 417 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Herpud2Q9JJC9 404 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cyp39a1Q9JKJ9 470 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klra10Q9R1G6 266 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 M1apQ9Z0E1 529 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Plxna2P70207 1894 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zbed5B2RPU8 756 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm3336J3QMQ6 198 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.9 ms