RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000017530.3

Traf4-201, Transcript of TNF receptor-associated factor 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Traf4, Length 2,078 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf4-201ENSMUST00000017530 Tspan3Q9QY33 253 aa26■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Ep400Q8CHI8 3072 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Slc10a3P21129 473 aa26■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Ttc39bQ8BYY4 617 aa26■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Serpina3bQ8BYY9 420 aa26■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Prrg2Q8R182 198 aa26■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Bzw1Q9CQC6 419 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm5485A0A1D5RM98 91 aa25.99■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm3336J3QMQ6 198 aa25.99■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Ap2a2P17427 938 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Ccnb1P24860 430 aa25.99■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Rab21P35282 222 aa25.99■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Brcc3P46737 291 aa25.99■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Hnrnph2P70333 449 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Pecam1Q08481 727 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Heatr3Q8BQM4 679 aa25.99■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Slc35f5Q8R314 524 aa25.99■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Evi2bQ8VD58 444 aa25.99■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Hip1Q8VD75 1029 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Olfr615Q8VGY4 313 aa25.99■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Cog2Q921L5 731 aa25.99■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Syap1Q9D5V6 365 aa25.99■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Casp8ap2Q9WUF3 1962 aa25.99■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm10717D3Z1I8 228 aa25.99■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Cyp2t4E9PWV0 503 aa25.99■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Ttc7bE9Q6P5 843 aa25.99■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gml2G5E8L7 176 aa25.99■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 E230025N22RikG5E8S3 482 aa25.99■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Ephb2P54763 986 aa25.99■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Vps45P97390 570 aa25.99■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 MylpfP97457 169 aa25.99■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Atp9bP98195 1146 aa25.99■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Fbxw2Q60584 422 aa25.99■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Dnajc8Q6NZB0 253 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Aldh5a1Q8BWF0 523 aa25.99■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Znf276Q8CE64 614 aa25.99■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 DeraQ91YP3 318 aa25.99■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Mrps22Q9CXW2 359 aa25.99■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Terb2Q9D494 218 aa25.99■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Adrm1Q9JKV1 407 aa25.99■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Syt5Q9R0N5 386 aa25.99■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Lilra5D3Z7A9 295 aa25.98■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Vmn2r104E9Q2J5 860 aa25.98■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Il12aP43431 215 aa25.98■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 B3gat3P58158 335 aa25.98■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 RnaselQ05921 735 aa25.98■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gpd1lQ3ULJ0 351 aa25.98■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Smarcd1Q61466 515 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Fnip2Q80TD3 1108 aa25.98■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 CenpuQ8C4M7 410 aa25.98■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 H2-Q4Q8HWB2 354 aa25.98■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Fbxw7Q8VBV4 629 aa25.98■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Zcchc14Q8VIG0 956 aa25.98■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Q9D4A5 307 aa25.98■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Map3k6Q9WTR2 1291 aa25.98■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Ccdc144bE9PVZ3 520 aa25.97■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 SmgcF6VRN1 385 aa25.97■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Dpysl2O08553 572 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Il2P04351 169 aa25.97■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Pdcd2P46718 343 aa25.97■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Psen1P49769 467 aa25.97■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Mc4rP56450 332 aa25.97■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Itga11P61622 1188 aa25.97■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Sparcl1P70663 650 aa25.97■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Hrh2P97292 397 aa25.97■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Skiv2lQ6NZR5 1244 aa25.97■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Clec2eQ80XD9 204 aa25.97■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 CcnyQ8BGU5 341 aa25.97■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Tmem209Q8BRG8 561 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Fam78aQ8C552 283 aa25.97■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 PygbQ8CI94 843 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Pnpt1Q8K1R3 783 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Rpa1Q8VEE4 623 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 PigxQ99LV7 254 aa25.97■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Chmp2aQ9DB34 222 aa25.97■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Tm9sf1Q9DBU0 606 aa25.97■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm36028A0A0U1RPM1 299 aa25.97■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 CcnoP0C242 352 aa25.97■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Sycp3P70281 254 aa25.97■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Inpp5fQ8CDA1 1132 aa25.97■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Lrrc66Q8K0B3 872 aa25.97■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Lims2Q91XD2 341 aa25.97■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 QpctQ9CYK2 362 aa25.97■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Sf3b1Q99NB9 1304 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Skint7A7XV04 395 aa25.96■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Ccdc13D3YV10 709 aa25.96■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm8369E9PZI3 166 aa25.96■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Hnrnph1O35737 449 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Olfm1O88998 485 aa25.96■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Zfy2P20662 777 aa25.96■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Fam171bQ14CH0 825 aa25.96■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Fbxw11Q5SRY7 542 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Olfr8Q60892 310 aa25.96■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Hif1aQ61221 836 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Sema3cQ62181 751 aa25.96■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Zfp759Q7M6X3 721 aa25.96■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Trpm4Q7TN37 1213 aa25.96■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Pdk1Q8BFP9 434 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gprc5aQ8BHL4 356 aa25.96■■□□□ 1.75
Traf4-201ENSMUST00000017530 Abraxas1Q8BPZ8 407 aa25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 46.6 ms