RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639599.1

TARDBP-231, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 1,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	15.37	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	15.37	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	EPHX1	P07099	455 aa		15.37	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	NCAM1	P13591	858 aa		15.37	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	RAD23B	P54727	409 aa		15.37	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF445	P59923	1031 aa		15.37	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	15.37	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	CETN1	Q12798	172 aa		15.37	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	FUT11	Q495W5	492 aa		15.37	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	MPPE1	Q53F39	396 aa		15.37	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	FYB2	Q5VWT5	728 aa		15.37	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		15.37	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		15.37	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	SEMA4D	Q92854	862 aa		15.37	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	ARID3A	Q99856	593 aa		15.37	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		15.37	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		15.37	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	CAPN10	Q9HC96	672 aa		15.37	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	15.37	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		15.37	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	HCN2	Q9UL51	889 aa		15.37	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		15.37	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	15.36	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		15.36	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	WASH3P	C4AMC7	463 aa		15.36	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		15.36	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	15.36	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	TIMM44	O43615	452 aa		15.36	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	KLKB1	P03952	638 aa		15.36	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	15.36	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	IL12RB1	P42701	662 aa		15.36	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	15.36	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	SEMA3B	Q13214	749 aa		15.36	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	CUL2	Q13617	745 aa		15.36	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	GEN1	Q17RS7	908 aa		15.36	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		15.36	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	15.36	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	CACUL1	Q86Y37	369 aa		15.36	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		15.36	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		15.36	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	CPXM2	Q8N436	756 aa		15.36	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	SNX19	Q92543	992 aa		15.36	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	15.36	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	15.36	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	GPR174	Q9BXC1	333 aa		15.36	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		15.36	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		15.36	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		15.36	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	15.36	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	FBXO10	Q9UK96	956 aa		15.36	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		15.36	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		15.36	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	EML5	Q05BV3	1969 aa		15.36	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	15.35	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599		A0A1B0GTW7	788 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	15.35	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	SETSIP	P0DME0	302 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	PDE4C	Q08493	712 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	ADIG	Q0VDE8	80 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	LRMP	Q12912	555 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC14A1	Q13336	389 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	PNOC	Q13519	176 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF234	Q14588	700 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	RAB41	Q5JT25	222 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	15.35	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	TATDN2	Q93075	761 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	SMARCE1	Q969G3	411 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	15.35	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	CACNA1B	Q00975	2339 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	THADA	Q6YHU6	1953 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	ACACB	O00763	2458 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	PSMA7	O14818	248 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	TSPAN3	O60637	253 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	CER1	O95813	267 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	VDR	P11473	427 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	LCP1	P13796	627 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	MAOB	P27338	520 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	PRCP	P42785	496 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	LRRC63	Q05C16	580 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	15.34	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	15.34	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	15.34	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	15.34	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	EDEM1	Q92611	657 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	15.34	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	NT5C1B	Q96P26	610 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	GSDMA	Q96QA5	445 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	NUP58	Q9BVL2	599 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	15.34	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		15.34	■□□□□ 0.05

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