RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	DERA	Q9Y315	318 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	MAP3K5	Q99683	1374 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	FLT1	P17948	1338 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A087WWL8	130 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616		E7EVH7	732 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616		H0Y626	953 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	MTSS1	O43312	755 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	LY86	O95711	162 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	CD1A	P06126	327 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	TM4SF1	P30408	202 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	NNMT	P40261	264 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	GLRB	P48167	497 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	MTM1	Q13496	603 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	BTBD16	Q32M84	506 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	CASC1	Q6TDU7	716 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	YAF2	Q8IY57	180 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	TEX9	Q8N6V9	391 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	SNX33	Q8WV41	574 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	RSC1A1	Q92681	617 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	CALML4	Q96GE6	196 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	APOPT1	Q96IL0	206 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	WRNIP1	Q96S55	665 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ABCG4	Q9H172	646 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	VPS16	Q9H269	839 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	GALNT8	Q9NY28	637 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	CROT	Q9UKG9	612 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		5.38	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	WNT10B	O00744	389 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	STX16	O14662	325 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	VILL	O15195	856 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	NUAK1	O60285	661 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	PHF2	O75151	1096 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	GPR32	O75388	356 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	RASSF9	O75901	435 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	TSPAN9	O75954	239 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	NTSR2	O95665	410 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	IL18BP	O95998	194 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF853	P0CG23	659 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	MST1	P26927	711 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ARL3	P36405	182 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC11A2	P49281	568 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	PPP5C	P53041	499 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	PER3	P56645	1201 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ANTXR2	P58335	489 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	CTXN1	P60606	82 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	STK4	Q13043	487 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	MMEL1	Q495T6	779 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	PRR31	Q5SQ13	230 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	KRT73	Q86Y46	540 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	OR8H3	Q8N146	312 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC15A4	Q8N697	577 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	SPSB4	Q96A44	273 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	C3orf49	Q96BT1	292 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	USP40	Q9NVE5	1235 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	CA14	Q9ULX7	337 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	LRRC37A3	O60309	1634 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	SH3D21	A4FU49	640 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	PTGES3L	E9PB15	166 aa		5.37	□□□□□ -1.55

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