RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR49Q8IV35 697 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEFF1Q8IYR6 380 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC127Q96BQ5 260 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-216ENST00000628306 CHP1Q99653 195 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-216ENST00000628306 APEX2Q9UBZ4 518 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa25.38■■□□□ 1.65
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CAPNS1-216ENST00000628306 PIP4P1Q86T03 277 aa25.36■■□□□ 1.65
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CAPNS1-216ENST00000628306 REXO1L1PQ8IX06 675 aa25.36■■□□□ 1.65
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CAPNS1-216ENST00000628306 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
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CAPNS1-216ENST00000628306 ENGP17813 658 aa25.34■■□□□ 1.65
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CAPNS1-216ENST00000628306 ELOVL4Q9GZR5 314 aa25.33■■□□□ 1.65
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CAPNS1-216ENST00000628306 DLATP10515 647 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
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CAPNS1-216ENST00000628306 ITPKAP23677 461 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 MAPK8P45983 427 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 SNX30Q5VWJ9 437 aa25.32■■□□□ 1.64
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