RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 UBR7Q8N806 425 aa23.14■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 WDR35Q9P2L0 1181 aa23.14■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 NUDT5Q9UKK9 219 aa23.14■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa23.13■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 TAF4O00268 1085 aa23.13■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 ARHGAP33O14559 1287 aa23.13■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 TRIM24O15164 1050 aa23.13■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 STC2O76061 302 aa23.13■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 SYPP08247 313 aa23.13■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 RALAP11233 206 aa23.13■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 HOXB2P14652 356 aa23.13■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 TYRP14679 529 aa23.13■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 C10orf76Q5T2E6 689 aa23.13■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 PIGZQ86VD9 579 aa23.13■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa23.13■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 ANKRD52Q8NB46 1076 aa23.13■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 BBS2Q9BXC9 721 aa23.13■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 ZNF217O75362 1048 aa23.12■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 FAM193AP78312 1265 aa23.12■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 SLC14A1Q13336 389 aa23.12■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 FOXR2Q6PJQ5 311 aa23.12■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 ARHGAP18Q8N392 663 aa23.12■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa23.11■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 PSMA7O14818 248 aa23.11■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 PMM2O15305 246 aa23.11■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 CD59P13987 128 aa23.11■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 BCAT1P54687 386 aa23.11■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 MIB1Q86YT6 1006 aa23.11■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 CEP63Q96MT8 703 aa23.11■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 CD248Q9HCU0 757 aa23.11■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 FBXO10Q9UK96 956 aa23.11■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 ZNF510Q9Y2H8 683 aa23.11■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa23.1■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 KLKB1P03952 638 aa23.1■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 CAPNS1P04632 268 aa23.1■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 NTSR1P30989 418 aa23.1■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 PPP1R2P41236 205 aa23.1■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 SLC8A3P57103 927 aa23.1■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 COG7P83436 770 aa23.1■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 STIM1Q13586 685 aa23.1■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 PM20D1Q6GTS8 502 aa23.1■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 TPGS1Q6ZTW0 290 aa23.1■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 BHLHA9Q7RTU4 235 aa23.1■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 DEFB119Q8N690 84 aa23.1■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 P2RY11Q96G91 374 aa23.1■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 HSPA12BQ96MM6 686 aa23.1■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 SUSD2Q9UGT4 822 aa23.1■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 MAN1B1Q9UKM7 699 aa23.1■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 TSPAN16Q9UKR8 245 aa23.1■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 GPSM3Q9Y4H4 160 aa23.1■■□□□ 1.29
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SRRT-218ENST00000620394 CISD3P0C7P0 127 aa23.09■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 CD44P16070 742 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 FMO5P49326 533 aa23.09■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 BST2Q10589 180 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa23.09■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 SGO2Q562F6 1265 aa23.09■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa23.09■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa23.09■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa23.09■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 OR2I1PQ8NGU4 316 aa23.09■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa23.09■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 GABRG3Q99928 467 aa23.09■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 DCLK3Q9C098 648 aa23.09■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 RASAL2Q9UJF2 1139 aa23.09■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 A0A1W2PQF6 199 aa23.08■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 PRRT4C9JH25 899 aa23.08■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 O00370 1275 aa23.08■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 DGKGP49619 791 aa23.08■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 TKTL1P51854 596 aa23.08■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 PDE4CQ08493 712 aa23.08■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 SCAPQ12770 1279 aa23.08■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 EFEMP1Q12805 493 aa23.08■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 TTI2Q6NXR4 508 aa23.08■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 TRIML1Q8N9V2 468 aa23.08■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 MARCH2Q9P0N8 246 aa23.08■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 CYP8B1Q9UNU6 501 aa23.08■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa23.08■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
SRRT-218ENST00000620394 TULP2O00295 520 aa23.07■■□□□ 1.28
SRRT-218ENST00000620394 GJB3O75712 270 aa23.07■■□□□ 1.28
SRRT-218ENST00000620394 ZBED1O96006 694 aa23.07■■□□□ 1.28
SRRT-218ENST00000620394 NDUFV2P19404 249 aa23.07■■□□□ 1.28
SRRT-218ENST00000620394 BMP6P22004 513 aa23.07■■□□□ 1.28
SRRT-218ENST00000620394 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
SRRT-218ENST00000620394 CHKAP35790 457 aa23.07■■□□□ 1.28
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