RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 SCAMP5Q8TAC9 235 aa20.22■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 FBXO32Q969P5 355 aa20.22■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 TMEM176AQ96HP8 235 aa20.22■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa20.22■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 FSCN3Q9NQT6 498 aa20.22■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF840PA6NDX5 716 aa20.21■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 PMM2O15305 246 aa20.21■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 NDUFS2O75306 463 aa20.21■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 GJB3O75712 270 aa20.21■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 AFPP02771 609 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 RAD23BP54727 409 aa20.21■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
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SGMS1-208ENST00000608287 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
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SGMS1-208ENST00000608287 BTBD8Q5XKL5 378 aa20.21■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa20.21■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 SLC4A11Q8NBS3 891 aa20.21■□□□□ 0.83
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SGMS1-208ENST00000608287 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa20.21■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
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SGMS1-208ENST00000608287 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
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SGMS1-208ENST00000608287 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
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SGMS1-208ENST00000608287 MED15Q96RN5 788 aa20.2■□□□□ 0.82
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SGMS1-208ENST00000608287 DACH1Q9UI36 760 aa20.2■□□□□ 0.82
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SGMS1-208ENST00000608287 ZNF883P0CG24 379 aa20.19■□□□□ 0.82
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SGMS1-208ENST00000608287 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
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SGMS1-208ENST00000608287 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SGMS1-208ENST00000608287 SGO2Q562F6 1265 aa20.16■□□□□ 0.82
SGMS1-208ENST00000608287 HECTD3Q5T447 861 aa20.16■□□□□ 0.82
SGMS1-208ENST00000608287 EMC10Q5UCC4 262 aa20.16■□□□□ 0.82
SGMS1-208ENST00000608287 ARHGAP17Q68EM7 881 aa20.16■□□□□ 0.82
SGMS1-208ENST00000608287 RHBDF2Q6PJF5 856 aa20.16■□□□□ 0.82
SGMS1-208ENST00000608287 RRAGAQ7L523 313 aa20.16■□□□□ 0.82
SGMS1-208ENST00000608287 IRF2BP1Q8IU81 584 aa20.16■□□□□ 0.82
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