RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 F8VP50 259 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.557e-11■■■■■ 42.7
CAPNS1-214ENST00000592483 UNGP13051 313 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 NSFP46459 744 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 RPL34P49207 117 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 EPHB3P54753 998 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 PDCLQ13371 301 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 ITIH5Q86UX2 942 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 PIGZQ86VD9 579 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM139Q8IV31 216 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 ZMIZ2Q8NF64 920 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 PCDHB18PQ96TA0 734 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM9BQ9NQ34 198 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 MSRB2Q9Y3D2 182 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 IGSF10Q6WRI0 2623 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 KIF11P52732 1056 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 C10orf76Q5T2E6 689 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 NAA35Q5VZE5 725 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 ACAD10Q6JQN1 1059 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 TTC9BQ8N6N2 239 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC4A5Q9BY07 1137 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM30AQ9NV96 361 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGAP6O43182 974 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 RTN2O75298 545 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 BEST1O76090 585 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 CSH1P0DML2 217 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 CSH2P0DML3 217 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 CACNA2D1P54289 1103 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 RAB41Q5JT25 222 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 WDTC1Q8N5D0 677 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIM11Q96F44 468 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 VCPIP1Q96JH7 1222 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 ZFYVE19Q96K21 471 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRC3BQ96PB8 259 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNK16Q96T55 309 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRC4Q9HBW1 653 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 NAGPAQ9UK23 515 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A087X0T9 212 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 HHLA1C9JL84 531 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM228BP0C875 321 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 ATF6P18850 670 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 DDR2Q16832 855 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM110Q86TL2 294 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 ERICH1Q86X53 443 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 NUP93Q8N1F7 819 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 SCML4Q8N228 414 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 ISCUQ9H1K1 167 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 FBXO44Q9H4M3 255 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 STRIP2Q9ULQ0 834 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 NENFQ9UMX5 172 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A1W2PRU2 124 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 DPYSL4O14531 572 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 TNFRSF10BO14763 440 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 SART1O43290 800 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 FBXO21O94952 628 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 LCA5LO95447 670 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 CALB1P05937 261 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 MMP8P22894 467 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 GABRB2P47870 512 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 PMF1Q6P1K2 205 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 TTLL2Q9BWV7 592 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRC3Q9BY71 257 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 SYNCQ9H7C4 482 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 OBP2AQ9NY56 170 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 IL37Q9NZH6 218 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 SOWAHDA6NJG2 315 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-214ENST00000592483 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-214ENST00000592483 NDUFA10O95299 355 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-214ENST00000592483 MYBL1P10243 752 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC5A3P53794 718 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-214ENST00000592483 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-214ENST00000592483 TNK2Q07912 1038 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-214ENST00000592483 SPA17Q15506 151 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-214ENST00000592483 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC122Q5T0U0 273 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-214ENST00000592483 KIAA1211LQ6NV74 962 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-214ENST00000592483 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-214ENST00000592483 CPA5Q8WXQ8 436 aa24.7■■□□□ 1.54
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