RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 ASB7Q9H672 318 aa15.6■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 PCDH18Q9HCL0 1135 aa15.6■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 CYB561D2O14569 222 aa15.6■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 P4HA1P13674 534 aa15.6■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 PTK7Q13308 1070 aa15.6■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 MTFR1Q15390 333 aa15.6■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 OTOAQ7RTW8 1153 aa15.6■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 PTPN18Q99952 460 aa15.6■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 USP29Q9HBJ7 922 aa15.6■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 CHKBQ9Y259 395 aa15.6■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 TCEA3O75764 348 aa15.59■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 CYP2C9P11712 490 aa15.59■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 TNFAIP2Q03169 654 aa15.59■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 LCLAT1Q6UWP7 414 aa15.59■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 UCMAQ8WVF2 138 aa15.59■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 RSAD1Q9HA92 442 aa15.59■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 HESX1Q9UBX0 185 aa15.59■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 CCDC78A2IDD5 438 aa15.59■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 STK10O94804 968 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 KITP10721 976 aa15.59■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 RARBP10826 455 aa15.59■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 GOT1P17174 413 aa15.59■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 TKTP29401 623 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 GJA8P48165 433 aa15.59■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 USP46P62068 366 aa15.59■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 NME3Q13232 169 aa15.59■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 ACVR2BQ13705 512 aa15.59■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 ARRDC4Q8NCT1 418 aa15.59■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 CFAP73A6NFT4 308 aa15.58■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 MAGEB2O15479 319 aa15.58■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 TYROBPO43914 113 aa15.58■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 KLC1Q07866 573 aa15.58■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 NOMO1Q15155 1222 aa15.58■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 FOXB2Q5VYV0 432 aa15.58■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 CASC4Q6P4E1 433 aa15.58■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 SPNS2Q8IVW8 549 aa15.58■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 LINC01465Q8N7H1 131 aa15.58■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 DCAKDQ8WVC6 231 aa15.58■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 DTNBP1Q96EV8 351 aa15.58■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 MAML3Q96JK9 1138 aa15.58■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 TTC25Q96NG3 672 aa15.58■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 KATNBL1Q9H079 304 aa15.58■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 SMYD2Q9NRG4 433 aa15.58■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 IKBKGQ9Y6K9 419 aa15.58■□□□□ 0.09
CTIF-205ENST00000587860 CITO14578 2027 aa15.58■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 SIP14410 1827 aa15.58■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 H0Y3Z8 333 aa15.58■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 SUPT3HO75486 399 aa15.58■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 MT-ND3P03897 115 aa15.58■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 BGNP21810 368 aa15.58■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 CYP2F1P24903 491 aa15.58■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 MDH1BQ5I0G3 518 aa15.58■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 MROH9Q5TGP6 573 aa15.58■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa15.58■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 ATXN10Q9UBB4 475 aa15.58■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 I3L4J1 428 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 APOL1O14791 398 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 ABHD2P08910 425 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 CTSHP09668 335 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 ABCG1P45844 678 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 SLC6A3Q01959 620 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 EFHC2Q5JST6 749 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 CEP128Q6ZU80 1094 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 CCNJLQ8IV13 435 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 RNF169Q8NCN4 708 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 FNIP1Q8TF40 1166 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 KCNN1Q92952 543 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 MS4A4AQ96JQ5 239 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 TBCBQ99426 244 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 SPON1Q9HCB6 807 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 FLRT1Q9NZU1 646 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 SPATA7Q9P0W8 599 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 PRKAG3Q9UGI9 489 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 ITGA11Q9UKX5 1188 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 BPTFQ12830 3046 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 TRIM49D1C9J1S8 452 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 USP12O75317 370 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 INHBAP08476 426 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 NAT1P18440 290 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 CYP2B6P20813 491 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 GSTT1P30711 240 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 SERPINB4P48594 390 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 PGGT1BP53609 377 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 DCAF6Q58WW2 860 aa15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
CTIF-205ENST00000587860 RELL1Q8IUW5 271 aa15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms