RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 P4HA2O15460 535 aa21.91■■□□□ 1.1
PPP4C-211ENST00000567642 CALCAP01258 141 aa21.91■■□□□ 1.1
PPP4C-211ENST00000567642 BRD2P25440 801 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PPP4C-211ENST00000567642 KCNH2Q12809 1159 aa21.91■■□□□ 1.1
PPP4C-211ENST00000567642 CPXM2Q8N436 756 aa21.91■■□□□ 1.1
PPP4C-211ENST00000567642 DEFB119Q8N690 84 aa21.91■■□□□ 1.1
PPP4C-211ENST00000567642 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PPP4C-211ENST00000567642 LMO3Q8TAP4 145 aa21.91■■□□□ 1.1
PPP4C-211ENST00000567642 KCTD13Q8WZ19 329 aa21.91■■□□□ 1.1
PPP4C-211ENST00000567642 GABRG3Q99928 467 aa21.91■■□□□ 1.1
PPP4C-211ENST00000567642 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PPP4C-211ENST00000567642 CNGB3Q9NQW8 809 aa21.91■■□□□ 1.1
PPP4C-211ENST00000567642 LNP1A1A4G5 178 aa21.9■■□□□ 1.1
PPP4C-211ENST00000567642 C4orf47A7E2U8 309 aa21.9■■□□□ 1.1
PPP4C-211ENST00000567642 WASH3PC4AMC7 463 aa21.9■■□□□ 1.1
PPP4C-211ENST00000567642 GNA14O95837 355 aa21.9■■□□□ 1.1
PPP4C-211ENST00000567642 NDUFV2P19404 249 aa21.9■■□□□ 1.1
PPP4C-211ENST00000567642 PTGER3P43115 390 aa21.9■■□□□ 1.1
PPP4C-211ENST00000567642 HARS2P49590 506 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PPP4C-211ENST00000567642 MFAP3P55082 362 aa21.9■■□□□ 1.1
PPP4C-211ENST00000567642 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PPP4C-211ENST00000567642 CNGA2Q16280 664 aa21.9■■□□□ 1.1
PPP4C-211ENST00000567642 GEN1Q17RS7 908 aa21.9■■□□□ 1.1
PPP4C-211ENST00000567642 PKDCCQ504Y2 493 aa21.9■■□□□ 1.1
PPP4C-211ENST00000567642 FOXR2Q6PJQ5 311 aa21.9■■□□□ 1.1
PPP4C-211ENST00000567642 ARHGEF19Q8IW93 802 aa21.9■■□□□ 1.1
PPP4C-211ENST00000567642 EHBP1Q8NDI1 1231 aa21.9■■□□□ 1.1
PPP4C-211ENST00000567642 UCMAQ8WVF2 138 aa21.9■■□□□ 1.1
PPP4C-211ENST00000567642 ABCC13Q9NSE7 274 aa21.9■■□□□ 1.1
PPP4C-211ENST00000567642 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
PPP4C-211ENST00000567642 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa21.9■■□□□ 1.1
PPP4C-211ENST00000567642 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PPP4C-211ENST00000567642 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
PPP4C-211ENST00000567642 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
PPP4C-211ENST00000567642 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
PPP4C-211ENST00000567642 GFRA2O00451 464 aa21.89■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 TM4SF5O14894 197 aa21.89■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 AP5Z1O43299 807 aa21.89■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 TSPAN3O60637 253 aa21.89■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 AFPP02771 609 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 DAOAP59103 153 aa21.89■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 IRX4P78413 519 aa21.89■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 STILQ15468 1287 aa21.89■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 LYSMD4Q5XG99 296 aa21.89■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 PMF1Q6P1K2 205 aa21.89■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 SLC36A4Q6YBV0 504 aa21.89■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 CREBRFQ8IUR6 639 aa21.89■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 TRIM59Q8IWR1 403 aa21.89■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 CYP8B1Q9UNU6 501 aa21.89■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 STON1Q9Y6Q2 735 aa21.89■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 LAMA1P25391 3075 aa21.89■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 MSI1O43347 362 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF217O75362 1048 aa21.88■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 STARD3Q14849 445 aa21.88■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 TRIM61Q5EBN2 209 aa21.88■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 SPDYCQ5MJ68 293 aa21.88■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa21.88■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 SYT12Q8IV01 421 aa21.88■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 SLC35F5Q8WV83 523 aa21.88■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 ZSWIM1Q9BR11 485 aa21.88■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 SLC6A17Q9H1V8 727 aa21.88■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM9BQ9NQ34 198 aa21.88■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 CLEC4EQ9ULY5 219 aa21.88■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 KRT5P13647 590 aa21.87■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 GCNT1Q02742 428 aa21.87■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 CAMK4Q16566 473 aa21.87■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 MPPE1Q53F39 396 aa21.87■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa21.87■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 FAM217AQ8IXS0 508 aa21.87■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 SCML4Q8N228 414 aa21.87■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 GOLGA1Q92805 767 aa21.87■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 CIPCQ9C0C6 399 aa21.87■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 MIS12Q9H081 205 aa21.87■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 CD248Q9HCU0 757 aa21.87■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM74BQ9NUR3 256 aa21.87■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 CKAP5Q14008 2032 aa21.86■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa21.86■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 GABBR2O75899 941 aa21.86■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 ITPKAP23677 461 aa21.86■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 DPP6P42658 865 aa21.86■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 IL12RB1P42701 662 aa21.86■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 MARSP56192 900 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 ARID5AQ03989 594 aa21.86■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 UAP1L1Q3KQV9 507 aa21.86■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 TRIML1Q8N9V2 468 aa21.86■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 CLEC4CQ8WTT0 213 aa21.86■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 IRGQQ8WZA9 623 aa21.86■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 MRGPRX1Q96LB2 322 aa21.86■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 KREMEN1Q96MU8 473 aa21.86■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa21.86■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 SLC2A11Q9BYW1 496 aa21.86■■□□□ 1.09
PPP4C-211ENST00000567642 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms