RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563333.1

SNAP23-205, Transcript of synaptosome associated protein 23, humanhuman

TSL 2

Gene SNAP23, Length 862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23-205ENST00000563333 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 PBKQ96KB5 322 aa5.08□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 REEP2Q9BRK0 252 aa5.08□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 PAAF1Q9BRP4 392 aa5.08□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 AGXT2Q9BYV1 514 aa5.08□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 MMRN2Q9H8L6 949 aa5.08□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 USP29Q9HBJ7 922 aa5.08□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 WASH6PQ9NQA3 447 aa5.08□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 FBXO28Q9NVF7 368 aa5.08□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 GABRQQ9UN88 632 aa5.08□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 DERAQ9Y315 318 aa5.08□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 VWA3AA6NCI4 1184 aa5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 PEX1O43933 1283 aa5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 CNPP09543 421 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 CD72P21854 359 aa5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 ADRA1DP25100 572 aa5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 GGT5P36269 586 aa5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 POLE2P56282 527 aa5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 FOXL2P58012 376 aa5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 TAS2R50P59544 299 aa5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 UBE3AQ05086 875 aa5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 CHRNDQ07001 517 aa5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 FAM187BQ17R55 369 aa5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 ZNF618Q5T7W0 954 aa5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 KIRREL2Q6UWL6 708 aa5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 NAPRTQ6XQN6 538 aa5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 Q6ZNX1 250 aa5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 TTC30AQ86WT1 665 aa5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 BEND2Q8NDZ0 799 aa5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 RSC1A1Q92681 617 aa5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 LENG9Q96B70 501 aa5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 SKA1Q96BD8 255 aa5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 PGBD1Q96JS3 809 aa5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 TTPALQ9BTX7 342 aa5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 GPR63Q9BZJ6 419 aa5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 CLPBQ9H078 707 aa5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 ARHGEF3Q9NR81 526 aa5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 DUSP22Q9NRW4 184 aa5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 NDUFAF4Q9P032 175 aa5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 ZNF69Q9UC07 566 aa5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 PSMD9O00233 223 aa5.06□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 KIAA0355O15063 1070 aa5.06□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 ADRA1BP35368 520 aa5.06□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 FOLR3P41439 243 aa5.06□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 CYP4F2P78329 520 aa5.06□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 GPC5P78333 572 aa5.06□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 GALNT2Q10471 571 aa5.06□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 TRPC3Q13507 836 aa5.06□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 DNASE1L3Q13609 305 aa5.06□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 TUBA3CQ13748 450 aa5.06□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 PTPRRQ15256 657 aa5.06□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa5.06□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 ATG16L1Q676U5 607 aa5.06□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 KIAA0895LQ68EN5 471 aa5.06□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 TUBA3EQ6PEY2 450 aa5.06□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 Q6YL49 198 aa5.06□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 PTCHD4Q6ZW05 846 aa5.06□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 BBS12Q6ZW61 710 aa5.06□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 KCNG4Q8TDN1 519 aa5.06□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 HAS1Q92839 578 aa5.06□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 ZUFSPQ96AP4 578 aa5.06□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 ARRDC3Q96B67 414 aa5.06□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 MMS19Q96T76 1030 aa5.06□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 KCNK9Q9NPC2 374 aa5.06□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 MGAT4CQ9UBM8 478 aa5.06□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa5.06□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 LMTK3Q96Q04 1460 aa5.06□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 C16orf96A6NNT2 1141 aa5.05□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 A8MVJ9 347 aa5.05□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 NKX2-8O15522 239 aa5.05□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 CYP2D6P10635 497 aa5.05□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 APEHP13798 732 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 GRK5P34947 590 aa5.05□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 MPLP40238 635 aa5.05□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 COPB1P53618 953 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 RCAN1P53805 252 aa5.05□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 EFEMP1Q12805 493 aa5.05□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 FOXE3Q13461 319 aa5.05□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 BMPR2Q13873 1038 aa5.05□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 DCTN1Q14203 1278 aa5.05□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SNAP23-205ENST00000563333 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms