RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557685.5

EFCAB11-213, Transcript of EF-hand calcium binding domain 11, human

TSL 3

Gene EFCAB11, Length 698 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFCAB11-213	ENST00000557685	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	PAF1	Q8N7H5	531 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	RILPL2	Q969X0	211 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	FAR2	Q96K12	515 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	PRRX2	Q99811	253 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	MECR	Q9BV79	373 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	TOR3A	Q9H497	397 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	PDP2	Q9P2J9	529 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	ZNF69	Q9UC07	566 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	GJD2	Q9UKL4	321 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685		M0QZQ0	153 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	NKX2-8	O15522	239 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	SH3BP5	O60239	455 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	PYGL	P06737	847 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	EBLN1	P0CF75	366 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	ALAD	P13716	330 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	ITPKB	P27987	946 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	SERPINA4	P29622	427 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	MCM2	P49736	904 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	RARRES1	P49788	294 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	PSG6	Q00889	435 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	ABHD18	Q0P651	414 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	LMAN2	Q12907	356 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	CBFB	Q13951	182 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	FAM187B	Q17R55	369 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	AAK1	Q2M2I8	961 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	GALNTL6	Q49A17	601 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	PCID2	Q5JVF3	399 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	TBC1D5	Q92609	795 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	NPIPB3	Q92617	1050 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	GOLGA1	Q92805	767 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	SNX18	Q96RF0	628 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685		A0A1B0GVC2	190 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	KRT38	O76015	456 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	CYP3A4	P08684	503 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	MATN1	P21941	496 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	DUSP1	P28562	367 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	THBS4	P35443	961 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	GPC5	P78333	572 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	CFHR3	Q02985	330 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685		Q6ZPA2	131 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	ZNF627	Q7L945	461 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	HERVK_113	Q902F9	699 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	CHODL	Q9H9P2	273 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	USP29	Q9HBJ7	922 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	RASSF1	Q9NS23	344 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	KCND3	Q9UK17	655 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	BAG5	Q9UL15	447 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	DERA	Q9Y315	318 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685		M0QYT0	321 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	PDE8B	O95263	885 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	C1R	P00736	705 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	HMGA2	P52926	109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	SOX10	P56693	466 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	TLE2	Q04725	743 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	TLE3	Q04726	772 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	DCTN1	Q14203	1278 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	FAM153C	Q494X1	144 aa		4.92	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms