RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553843.5

RHOXF1-AS1-201, RHOXF1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RHOXF1-AS1, Length 2,102 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 TBX18O95935 607 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 ZBED1O96006 694 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 ARSAP15289 507 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CD72P21854 359 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 MCM3P25205 808 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 NOP2P46087 812 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SOX9P48436 509 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 IFNAR2P48551 515 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 TUBP50607 506 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SLC7A9P82251 487 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 ZXDBP98169 803 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 C2orf54Q08AI8 447 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SNX30Q5VWJ9 437 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 DNAAF5Q86Y56 855 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 FAM71AQ8IYT1 594 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 MMGT1Q8N4V1 131 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 FBXL6Q8N531 539 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SPATA4Q8NEY3 305 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SLC35F5Q8WV83 523 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 FOXQ1Q9C009 403 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 MIS12Q9H081 205 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 EBF3Q9H4W6 596 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 GTSE1Q9NYZ3 720 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CFAP97Q9P2B7 532 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 ARNTLO00327 626 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 RALAP11233 206 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 TNFAIP3P21580 790 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 GALCP54803 685 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 VCPP55072 806 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 C10orf120Q5SQS8 335 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 TAF3Q5VWG9 929 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CCDC70Q6NSX1 233 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 ARHGAP18Q8N392 663 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 LRRC57Q8N9N7 239 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 TPCN2Q8NHX9 752 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CLEC4CQ8WTT0 213 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 KCTD13Q8WZ19 329 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CYLDQ9NQC7 956 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 RASAL2Q9UJF2 1139 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 PIAS3Q9Y6X2 628 aa8.5□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 ATG2BQ96BY7 2078 aa8.49□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CES2O00748 559 aa8.49□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 MAP2K7O14733 419 aa8.49□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 GABBR2O75899 941 aa8.49□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 HMBSP08397 361 aa8.49□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 GPD2P43304 727 aa8.49□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 PSEN1P49768 467 aa8.49□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 DAOAP59103 153 aa8.49□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 PRKCQQ04759 706 aa8.49□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 EFEMP1Q12805 493 aa8.49□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 UBXN2BQ14CS0 331 aa8.49□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 BTBD8Q5XKL5 378 aa8.49□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 BHLHA9Q7RTU4 235 aa8.49□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 HDXQ7Z353 690 aa8.49□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 MIB1Q86YT6 1006 aa8.49□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 OSCP1Q8WVF1 389 aa8.49□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 EDEM1Q92611 657 aa8.49□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SHDQ96IW2 340 aa8.49□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 HPS4Q9NQG7 708 aa8.49□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CNGB3Q9NQW8 809 aa8.49□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa8.49□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CYTH4Q9UIA0 394 aa8.49□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa8.49□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa8.48□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 YJEFN3A6XGL0 299 aa8.48□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 E7ENQ6 273 aa8.48□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 PI15O43692 258 aa8.48□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 TMEM253P0C7T8 217 aa8.48□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CYP11B1P15538 503 aa8.48□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 STARD6P59095 220 aa8.48□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 BPIFB4P59827 614 aa8.48□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 PDCLQ13371 301 aa8.48□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 RUNX3Q13761 415 aa8.48□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 PDGFRLQ15198 375 aa8.48□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 RPS6KA1Q15418 735 aa8.48□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa8.48□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 MAP9Q49MG5 647 aa8.48□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 PM20D1Q6GTS8 502 aa8.48□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SLFN11Q7Z7L1 901 aa8.48□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 TADA2BQ86TJ2 420 aa8.48□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SYCE1Q8N0S2 351 aa8.48□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 TMEM105Q8N8V8 129 aa8.48□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 RFFLQ8WZ73 363 aa8.48□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 RUBCNQ92622 972 aa8.48□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 WBP2Q969T9 261 aa8.48□□□□□ -1.05
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 MS4A14Q96JA4 679 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.5 ms