RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550159.5

CS-218, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-218ENST00000550159 FECHP22830 423 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 PSMA2P25787 234 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 MATKP42679 507 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 RPL34P49207 117 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 SLC11A2P49281 568 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 GALCP54803 685 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 GSCP56915 257 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 ZNF528Q3MIS6 628 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 NUGGCQ68CJ6 796 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 MON1BQ7L1V2 547 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 XYLT1Q86Y38 959 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 TTC16Q8NEE8 873 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 FEZF2Q8TBJ5 459 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 NETO1Q8TDF5 533 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 RSAD2Q8WXG1 361 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 MCEEQ96PE7 176 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 CRISPLD1Q9H336 500 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 PARD6AQ9NPB6 346 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 MARCH2Q9P0N8 246 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 RASAL2Q9UJF2 1139 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 ANAPC7Q9UJX3 599 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 GMEB2Q9UKD1 530 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 HHLA1C9JL84 531 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 LAMTOR5O43504 91 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 SPOPO43791 374 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 PRPSAP2O60256 369 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 LCA5LO95447 670 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 CYBBP04839 570 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 GLULP15104 373 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 RRM1P23921 792 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 CCR1P32246 355 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 SLC1A1P43005 524 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 SULT1E1P49888 294 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 CACNA2D1P54289 1103 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 EPHA5P54756 1037 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 AMPD2Q01433 879 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 DEUP1Q05D60 604 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 EFEMP1Q12805 493 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 NR1H3Q13133 447 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 NME3Q13232 169 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 CCDC142Q17RM4 750 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 SLC25A52Q3SY17 297 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 SNX30Q5VWJ9 437 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 LRRC31Q6UY01 552 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 MIB1Q86YT6 1006 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 ZNF276Q8N554 614 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 MAB21L3Q8N8X9 362 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 ZMIZ2Q8NF64 920 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 FNIP1Q8TF40 1166 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 NXPE3Q969Y0 559 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 PLD4Q96BZ4 506 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 MCRS1Q96EZ8 462 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 PCDHB18PQ96TA0 734 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 ZSWIM1Q9BR11 485 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 CNPY3Q9BT09 278 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 THAP2Q9H0W7 228 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 ZFP14Q9HCL3 533 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 ARHGEF3Q9NR81 526 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 DDIT4Q9NX09 232 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 IL37Q9NZH6 218 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 TBC1D14Q9P2M4 693 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 CDH7Q9ULB5 785 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
CS-218ENST00000550159 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-218ENST00000550159 SLC12A8A0AV02 714 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-218ENST00000550159 FAM92AA1XBS5 289 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-218ENST00000550159 YJEFN3A6XGL0 299 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-218ENST00000550159 E7ENQ6 273 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-218ENST00000550159 M0QYT0 321 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-218ENST00000550159 TULP2O00295 520 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-218ENST00000550159 GRAP2O75791 330 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-218ENST00000550159 VNN2O95498 520 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-218ENST00000550159 CYP1A2P05177 515 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-218ENST00000550159 SRFP11831 508 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-218ENST00000550159 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
CS-218ENST00000550159 PMLP29590 882 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-218ENST00000550159 RDXP35241 583 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
CS-218ENST00000550159 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
CS-218ENST00000550159 AIF1P55008 147 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-218ENST00000550159 TBX4P57082 545 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-218ENST00000550159 SPEM2Q0P670 501 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-218ENST00000550159 NNTQ13423 1086 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-218ENST00000550159 MAMLD1Q13495 774 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-218ENST00000550159 TEAD2Q15562 447 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-218ENST00000550159 EFHC2Q5JST6 749 aa10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms