RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547188.1

PRDM4-202, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 3

Gene PRDM4, Length 640 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-202ENST00000547188 MCM6Q14566 821 aa24.8■■□□□ 1.56
PRDM4-202ENST00000547188 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa24.8■■□□□ 1.56
PRDM4-202ENST00000547188 CIPCQ9C0C6 399 aa24.8■■□□□ 1.56
PRDM4-202ENST00000547188 IGHV4-34P06331 123 aa24.79■■□□□ 1.56
PRDM4-202ENST00000547188 ABCD1P33897 745 aa24.79■■□□□ 1.56
PRDM4-202ENST00000547188 RACK1P63244 317 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
PRDM4-202ENST00000547188 GABREP78334 506 aa24.79■■□□□ 1.56
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF366Q8N895 744 aa24.79■■□□□ 1.56
PRDM4-202ENST00000547188 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa24.79■■□□□ 1.56
PRDM4-202ENST00000547188 ELOVL2Q9NXB9 296 aa24.79■■□□□ 1.56
PRDM4-202ENST00000547188 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa24.79■■□□□ 1.56
PRDM4-202ENST00000547188 VWA3AA6NCI4 1184 aa24.78■■□□□ 1.56
PRDM4-202ENST00000547188 MDM4O15151 490 aa24.78■■□□□ 1.56
PRDM4-202ENST00000547188 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PRDM4-202ENST00000547188 EXD3Q8N9H8 876 aa24.78■■□□□ 1.56
PRDM4-202ENST00000547188 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa24.78■■□□□ 1.56
PRDM4-202ENST00000547188 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa24.78■■□□□ 1.56
PRDM4-202ENST00000547188 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
PRDM4-202ENST00000547188 IL37Q9NZH6 218 aa24.78■■□□□ 1.56
PRDM4-202ENST00000547188 CLEC4EQ9ULY5 219 aa24.78■■□□□ 1.56
PRDM4-202ENST00000547188 NOTCH2Q04721 2471 aa24.78■■□□□ 1.56
PRDM4-202ENST00000547188 FAM47DPA6NHR8 397 aa24.77■■□□□ 1.56
PRDM4-202ENST00000547188 DDIT3P35638 169 aa24.77■■□□□ 1.56
PRDM4-202ENST00000547188 TMEM215Q68D42 235 aa24.77■■□□□ 1.56
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF720Q7Z2F6 126 aa24.77■■□□□ 1.56
PRDM4-202ENST00000547188 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
PRDM4-202ENST00000547188 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
PRDM4-202ENST00000547188 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa24.77■■□□□ 1.56
PRDM4-202ENST00000547188 INTS13Q9NVM9 706 aa24.77■■□□□ 1.56
PRDM4-202ENST00000547188 NUDT5Q9UKK9 219 aa24.77■■□□□ 1.56
PRDM4-202ENST00000547188 LRRK2Q5S007 2527 aa24.76■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 PENKP01210 267 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 GOLGA8FQ08AF8 430 aa24.76■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa24.76■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 FYB2Q5VWT5 728 aa24.76■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 KIAA0895LQ68EN5 471 aa24.76■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 Q6ZNB5 142 aa24.76■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa24.76■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 PCIF1Q9H4Z3 704 aa24.76■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 EBF2Q9HAK2 575 aa24.76■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 K7ENP7 123 aa24.75■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 WNT9AO14904 365 aa24.75■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 MYF5P13349 255 aa24.75■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 SFR1Q86XK3 245 aa24.75■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa24.75■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 VCPIP1Q96JH7 1222 aa24.75■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 MED10Q9BTT4 135 aa24.75■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 DPH1Q9BZG8 443 aa24.75■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa24.75■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 OSER1Q9NX31 292 aa24.75■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 A0A1W2PPC4 97 aa24.74■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 FAM92AA1XBS5 289 aa24.74■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 A8MXQ7 604 aa24.74■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 TNNC2P02585 160 aa24.74■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 GP1BBP13224 206 aa24.74■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 RPS14P62263 151 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 FAM35AQ86V20 835 aa24.74■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 CBWD1Q9BRT8 395 aa24.74■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 GDF3Q9NR23 364 aa24.74■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa24.73■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 USP12O75317 370 aa24.73■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 TACC1O75410 805 aa24.73■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 PPP1R37O75864 691 aa24.73■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 LDHAP00338 332 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 DNTTP04053 509 aa24.73■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 ACP1P24666 158 aa24.73■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 ARID5AQ03989 594 aa24.73■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 SFMBT2Q5VUG0 894 aa24.73■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 ATG14Q6ZNE5 492 aa24.73■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 PAQR9Q6ZVX9 377 aa24.73■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 LSMEM2Q8N112 164 aa24.73■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 SKA1Q96BD8 255 aa24.73■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 SGK2Q9HBY8 427 aa24.73■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 ASCL3Q9NQ33 180 aa24.73■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 TBC1D7Q9P0N9 293 aa24.73■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 SSUH2Q9Y2M2 353 aa24.73■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 YKT6O15498 198 aa24.72■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 DXOO77932 396 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 CD38P28907 300 aa24.72■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 ERVPABLB-1P60509 514 aa24.72■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 HVCN1Q96D96 273 aa24.72■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 KLKB1P03952 638 aa24.71■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 E2F1Q01094 437 aa24.71■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 PROX2Q3B8N5 592 aa24.71■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa24.71■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa24.71■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 RAD54LQ92698 747 aa24.71■■□□□ 1.55
PRDM4-202ENST00000547188 STRA6Q9BX79 667 aa24.71■■□□□ 1.55
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