RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538545.6

ACTN1-205, Transcript of actinin alpha 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTN1, Length 2,813 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-205ENST00000538545 HIF1AQ16665 826 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 TLCD1Q96CP7 247 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 FAF2Q96CS3 445 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 SIK2Q9H0K1 926 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 NMUR1Q9HB89 426 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 CYLDQ9NQC7 956 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 CNGB3Q9NQW8 809 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 SEPT10Q9P0V9 454 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 STAP1Q9ULZ2 295 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 CHMP2BQ9UQN3 213 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 ANKRD65E5RJM6 399 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 EOMESO95936 686 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 APRTP07741 180 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 ACTN2P35609 894 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 GPX6P59796 221 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 USP46P62068 366 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 PPP2R2AP63151 447 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 FAM189BP81408 668 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 TSPY1Q01534 308 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 MORF4L2Q15014 288 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 LRRC14Q15048 493 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.073e-6■□□□□ 10.9
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ACTN1-205ENST00000538545 TKTL2Q9H0I9 626 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 KIF9Q9HAQ2 790 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 UBN1Q9NPG3 1134 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 OSER1Q9NX31 292 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 CLUHO75153 1309 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 SKIP12755 728 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 CCL5P13501 91 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 ARL4AP40617 200 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 CAV1Q03135 178 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 EXOC3L1Q86VI1 746 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 HOOK3Q86VS8 718 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 PPIL6Q8IXY8 311 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 THEM5Q8N1Q8 247 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 URGCPQ8TCY9 931 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 CASD1Q96PB1 797 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 DNAI2Q9GZS0 605 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 CRISPLD1Q9H336 500 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 ETNK1Q9HBU6 452 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 KCNK1O00180 336 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 SRGAP2BP0DMP2 458 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 ADRA1BP35368 520 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 SLC11A1P49279 550 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 SKOR1P84550 965 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 ZSCAN26Q16670 478 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 SMYD5Q6GMV2 418 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 BBOF1Q8ND07 529 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 CCNYQ8ND76 341 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 FBXO36Q8NEA4 188 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 RNF34Q969K3 372 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 COLEC11Q9BWP8 271 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 UNC80Q8N2C7 3258 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 MYO7AQ13402 2215 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 TBKBP1A7MCY6 615 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 DNM1LO00429 736 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 GNRH1P01148 92 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 RPL17P18621 184 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 GCAP28676 217 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 LSP1P33241 339 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 SCNN1AP37088 669 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 MDH1P40925 334 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 AP1B1Q10567 949 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 TRIM60Q495X7 471 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 AGBL2Q5U5Z8 902 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 ARCQ7LC44 396 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 BNIPLQ7Z465 357 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 NPWQ8N729 165 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 BCAS4Q8TDM0 211 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 TMEM161AQ9NX61 479 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 SQORQ9Y6N5 450 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 TGM2P21980 687 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 IFNAR2P48551 515 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 TMED2Q15363 201 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 SPDYCQ5MJ68 293 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 CCHCR1Q8TD31 782 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 HIPK3Q9H422 1215 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 MARCH5Q9NX47 278 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 C2CD2LO14523 706 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 TBX18O95935 607 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 CHN1P15882 459 aa14.61□□□□□ -0.07
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