RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 INSL5Q9Y5Q6 135 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 EYSQ5T1H1 3165 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 MSI1O43347 362 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 ADRA1BP35368 520 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 CLCN4P51793 760 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 TCEAL5Q5H9L2 206 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 TTC27Q6P3X3 843 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 CALN1Q9BXU9 219 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 AP4E1Q9UPM8 1137 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 RARGP13631 454 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC7A5Q01650 507 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 PPP2R5EQ16537 467 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 ODF2Q5BJF6 829 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 ATG4AQ8WYN0 398 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 SMOC2Q9H3U7 446 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 F9P00740 461 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 CLUL1Q15846 466 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 DPYSL2Q16555 572 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 CYP1B1Q16678 543 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 ARHGAP18Q8N392 663 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 MICALL1Q8N3F8 863 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 MYRFLQ96LU7 910 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 TRIM62Q9BVG3 475 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 IGFLR1Q9H665 355 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 CCSER2Q9H7U1 834 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 CLIC5Q9NZA1 410 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 CCDC188H7C350 402 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 IRAK2O43187 625 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 CSH1P0DML2 217 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 CSH2P0DML3 217 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 PDK2Q15119 407 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 MSANTD2Q6P1R3 559 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 RNF139Q8WU17 664 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 PNKPQ96T60 521 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 AMACRQ9UHK6 382 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 SNX10Q9Y5X0 201 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM72CH0Y354 149 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 RAD51CO43502 376 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 KCNJ1P48048 391 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 KRT81Q14533 505 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM72AQ5TYM5 149 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM72DQ6L9T8 149 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 TMEM150AQ86TG1 271 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM72BQ86X60 149 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 PQLC3Q8N755 202 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 PCDH19Q8TAB3 1148 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 RNF157Q96PX1 679 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 DCLK3Q9C098 648 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 WDCPQ9H6R7 721 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 EFR3BQ9Y2G0 817 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF840PA6NDX5 716 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 CST8O60676 142 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 TJP3O95049 919 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 CETN2P41208 172 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 DYNLT1P63172 113 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 HYAL1Q12794 435 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 SNX1Q13596 522 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 RTL10Q7L3V2 364 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 EFHBQ8N7U6 833 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 KREMEN2Q8NCW0 462 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 NTAN1Q96AB6 310 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 TKTL2Q9H0I9 626 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 PHF2O75151 1096 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 ZMYND10O75800 440 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 EFEMP1Q12805 493 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 PLD1Q13393 1074 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 SNX30Q5VWJ9 437 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 CCDC149Q6ZUS6 474 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 BBS12Q6ZW61 710 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 RFX6Q8HWS3 928 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC22A17Q8WUG5 538 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 HAUS1Q96CS2 278 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 PARD6BQ9BYG5 372 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 LRRC19Q9H756 370 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 GBP1P32455 592 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 COILP38432 576 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 PTGIRP43119 386 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 PSEN1P49768 467 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 EPHB3P54753 998 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 TUBB4BP68371 445 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 SCAPQ12770 1279 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 ARTNQ5T4W7 220 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
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