RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527006.1

TSTA3-205, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 3

Gene TSTA3, Length 412 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-205ENST00000527006 CDH7Q9ULB5 785 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-205ENST00000527006 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-205ENST00000527006 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa14.91□□□□□ -0.02
TSTA3-205ENST00000527006 TRANK1O15050 2925 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-205ENST00000527006 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-205ENST00000527006 A0A0U1RQJ8 604 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-205ENST00000527006 MOSPD3O75425 235 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-205ENST00000527006 LRCH4O75427 683 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-205ENST00000527006 LATS1O95835 1130 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-205ENST00000527006 GJA1P17302 382 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-205ENST00000527006 KCNA5P22460 613 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-205ENST00000527006 CCR2P41597 374 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-205ENST00000527006 HDAC4P56524 1084 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-205ENST00000527006 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-205ENST00000527006 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-205ENST00000527006 RPS6KA1Q15418 735 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-205ENST00000527006 SLC5A9Q2M3M2 681 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-205ENST00000527006 TRNP1Q6NT89 227 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-205ENST00000527006 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-205ENST00000527006 BNIPLQ7Z465 357 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-205ENST00000527006 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-205ENST00000527006 TEKT4Q8WW24 435 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-205ENST00000527006 ATRIPQ8WXE1 791 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-205ENST00000527006 NTAN1Q96AB6 310 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-205ENST00000527006 BTN2A3PQ96KV6 586 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-205ENST00000527006 HAPLN3Q96S86 360 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-205ENST00000527006 CYP2S1Q96SQ9 504 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-205ENST00000527006 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-205ENST00000527006 RNF38Q9H0F5 515 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-205ENST00000527006 PIGVQ9NUD9 493 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-205ENST00000527006 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-205ENST00000527006 PCSK1NQ9UHG2 260 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-205ENST00000527006 CPQQ9Y646 472 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-205ENST00000527006 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa14.9□□□□□ -0.02
TSTA3-205ENST00000527006 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 CTAGE9A4FU28 777 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 ESPNB1AK53 854 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 TCF3P15923 654 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 CEBPBP17676 345 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 CASQ1P31415 396 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 ADRA1BP35368 520 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 RWDD2BP57060 319 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 ETF1P62495 437 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 AAK1Q2M2I8 961 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 MEI1Q5TIA1 1274 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 MTSS1LQ765P7 747 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 NT5DC3Q86UY8 548 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 FAM131BQ86XD5 332 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 ITFG1Q8TB96 612 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 ING5Q8WYH8 240 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 FGF13Q92913 245 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 SMARCD2Q92925 531 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 SLC39A13Q96H72 371 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 TKTL2Q9H0I9 626 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 OBP2AQ9NY56 170 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 DONSONQ9NYP3 566 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 STIM2Q9P246 746 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 NR2E1Q9Y466 385 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 CHD7Q9P2D1 2997 aa14.89□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 E2F8A0AVK6 867 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 KCNU1A8MYU2 1149 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 H3BQ06 376 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 MDM4O15151 490 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 FTCDO95954 541 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 HMBSP08397 361 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 TNNT1P13805 278 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 CTNNA2P26232 953 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 HTR7P34969 479 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 SCAPQ12770 1279 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 KRT81Q14533 505 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 PDK2Q15119 407 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 CLUL1Q15846 466 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 LEXMQ3ZCV2 418 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 LRRC31Q6UY01 552 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 NPAS3Q8IXF0 933 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 RCOR2Q8IZ40 523 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 SLC35F6Q8N357 371 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 KCTD6Q8NC69 237 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 SUSD6Q92537 303 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 C1orf74Q96LT6 269 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 OSBPL2Q9H1P3 480 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 ZWILCHQ9H900 591 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 ZFP14Q9HCL3 533 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms