RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515159.5

SLC38A9-222, Transcript of solute carrier family 38 member 9, human

TSL 2

Gene SLC38A9, Length 3,509 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC38A9-222	ENST00000515159	CEP44	Q9C0F1	390 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	COMMD8	Q9NX08	183 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	STK39	Q9UEW8	545 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	NARF	Q9UHQ1	456 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	EMCN	Q9ULC0	261 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	TBC1D4	O60343	1298 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	UGT1A9	O60656	530 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	HAUS5	O94927	633 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLC34A2	O95436	690 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	PLCG1	P19174	1290 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	UGT1A6	P19224	532 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	ABCB4	P21439	1286 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	UGT1A1	P22309	533 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	UGT1A4	P22310	534 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	HSPA1L	P34931	641 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	UGT1A3	P35503	534 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	UGT1A5	P35504	534 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLC5A3	P53794	718 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	GALC	P54803	685 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	PRKCQ	Q04759	706 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	TEF	Q10587	303 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	SPP2	Q13103	211 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	SPARCL1	Q14515	664 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	LRRC41	Q15345	812 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	CENPU	Q71F23	418 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF566	Q969W8	418 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	MUC3B	Q9H195	1237 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	GID8	Q9NWU2	228 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	KL	Q9UEF7	1012 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	RAD54B	Q9Y620	910 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	PLXNB2	O15031	1838 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159		A0A1W2PPM1	405 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	LINC00862	A6NCI5	91 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF487	B1APH4	448 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	ADAM11	O75078	769 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	OCM2	P0CE71	109 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	IMPDH1	P20839	514 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	LTK	P29376	864 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	ADORA1	P30542	326 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	PDE4D	Q08499	809 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	PTK2B	Q14289	1009 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	KRT81	Q14533	505 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	HERC3	Q15034	1050 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	FGD3	Q5JSP0	725 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	CYS1	Q717R9	158 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	WDR49	Q8IV35	697 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	RNF34	Q969K3	372 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	PSKH2	Q96QS6	385 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	CD209	Q9NNX6	404 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	HEY2	Q9UBP5	337 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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