RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa17.57■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC30A4O14863 429 aa17.57■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NPC1O15118 1278 aa17.57■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRT5P13647 590 aa17.57■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HOXB2P14652 356 aa17.57■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MPLP40238 635 aa17.57■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ACADSBP45954 432 aa17.57■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MPPE1Q53F39 396 aa17.57■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPDYCQ5MJ68 293 aa17.57■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa17.57■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CHPFQ8IZ52 775 aa17.57■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HMGB4Q8WW32 186 aa17.57■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF606Q8WXB4 792 aa17.57■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GOLGA1Q92805 767 aa17.57■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BHMTQ93088 406 aa17.57■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CRACR2AQ9BSW2 395 aa17.57■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 THAP9Q9H5L6 903 aa17.57■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP17.57■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 INVSQ9Y283 1065 aa17.57■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DNAH14Q0VDD8 3507 aa17.57■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ABCA7Q8IZY2 2146 aa17.56■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A1W2PQF6 199 aa17.56■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SART1O43290 800 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CALCAP01258 141 aa17.56■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LTFP02788 710 aa17.56■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC9A1P19634 815 aa17.56■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LIMK1P53667 647 aa17.56■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EXOC3L4Q17RC7 722 aa17.56■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADGRF1Q5T601 910 aa17.56■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BEND5Q7L4P6 421 aa17.56■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM114A1Q8IWE2 563 aa17.56■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UNC45BQ8IWX7 931 aa17.56■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PGBD3Q8N328 593 aa17.56■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DDI1Q8WTU0 396 aa17.56■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AZIN2Q96A70 460 aa17.56■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPACA7Q96KW9 195 aa17.56■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ACOX2Q99424 681 aa17.56■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CD248Q9HCU0 757 aa17.56■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 APEX2Q9UBZ4 518 aa17.56■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DACH1Q9UI36 760 aa17.56■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PIK3R2O00459 728 aa17.55■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TIMM44O43615 452 aa17.55■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GDF9O60383 454 aa17.55■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CAVIN2O95810 425 aa17.55■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGLV3-27P01718 113 aa17.55■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GABRG2P18507 467 aa17.55■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PON1P27169 355 aa17.55■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CREB5Q02930 508 aa17.55■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RING1Q06587 406 aa17.55■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAP7D1Q3KQU3 841 aa17.55■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SCUBE3Q8IX30 993 aa17.55■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UCMAQ8WVF2 138 aa17.55■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RLN3Q8WXF3 142 aa17.55■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRIM62Q9BVG3 475 aa17.55■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC4A5Q9BY07 1137 aa17.55■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NUP62CLQ9H1M0 184 aa17.55■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAP3K13O43283 966 aa17.54■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BCKDHBP21953 392 aa17.54■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GNA15P30679 374 aa17.54■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WASP42768 502 aa17.54■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ENPP2Q13822 863 aa17.54■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC6Q16204 474 aa17.54■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAN2A1Q16706 1144 aa17.54■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GEN1Q17RS7 908 aa17.54■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MPP7Q5T2T1 576 aa17.54■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NUGGCQ68CJ6 796 aa17.54■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GJB7Q6PEY0 223 aa17.54■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LPCAT2Q7L5N7 544 aa17.54■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa17.54■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM110Q86TL2 294 aa17.54■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CLEC4CQ8WTT0 213 aa17.54■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MIS12Q9H081 205 aa17.54■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ST7Q9NRC1 585 aa17.54■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BECN2A8MW95 431 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 THAP12O43422 761 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF217O75362 1048 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FYNP06241 537 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NCAM1P13591 858 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC11A2P49281 568 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NNTQ13423 1086 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DPCR1Q3MIW9 517 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DENND1BQ6P3S1 775 aa17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms