RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510195.1

SNF8-208, Transcript of SNF8, ESCRT-II complex subunit, human

TSL 2

Gene SNF8, Length 445 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNF8-208	ENST00000510195	GCNT1	Q02742	428 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	UBA3	Q8TBC4	463 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	UCMA	Q8WVF2	138 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	PIGK	Q92643	395 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	ACACB	O00763	2458 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	LATS1	O95835	1130 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	LMAN2	Q12907	356 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	FRMD1	Q8N878	549 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	P2RY11	Q96G91	374 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195		E7ENQ6	273 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	PTGER3	P43115	390 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	MPPE1	Q53F39	396 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	TFAP2B	Q92481	460 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	HSFY1	Q96LI6	401 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	27.86	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	C4orf47	A7E2U8	309 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	TIMM44	O43615	452 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	NDUFV2	P19404	249 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	DAOA	P59103	153 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	KCNH2	Q12809	1159 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	PAK1	Q13153	545 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	ENPP2	Q13822	863 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	STARD3	Q14849	445 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	DDI1	Q8WTU0	396 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	KCNK5	O95279	499 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	IRX4	P78413	519 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	GEN1	Q17RS7	908 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	PMF1	Q6P1K2	205 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	CEP76	Q8TAP6	659 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	PI4KA	P42356	2102 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	PATE3	B3GLJ2	98 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	LCP1	P13796	627 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	EDEM1	Q92611	657 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	27.83	■■■□□ 2.05
SNF8-208	ENST00000510195	BIN1	O00499	593 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SNF8-208	ENST00000510195	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
SNF8-208	ENST00000510195	FBXO21	O94952	628 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SNF8-208	ENST00000510195	ADGRF1	Q5T601	910 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SNF8-208	ENST00000510195	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
SNF8-208	ENST00000510195	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
SNF8-208	ENST00000510195	RAD54B	Q9Y620	910 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SNF8-208	ENST00000510195	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SNF8-208	ENST00000510195	WASH3P	C4AMC7	463 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SNF8-208	ENST00000510195		M0QYV0	167 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SNF8-208	ENST00000510195	ZNF33A	Q06730	810 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SNF8-208	ENST00000510195	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SNF8-208	ENST00000510195	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
SNF8-208	ENST00000510195	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SNF8-208	ENST00000510195	RRAGA	Q7L523	313 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SNF8-208	ENST00000510195	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SNF8-208	ENST00000510195	GOLGA1	Q92805	767 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SNF8-208	ENST00000510195	KAT5	Q92993	513 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SNF8-208	ENST00000510195	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		27.81	■■■□□ 2.04

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