RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509165.1

NFKB1-208, Transcript of nuclear factor kappa B subunit 1, human

TSL 5

Gene NFKB1, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFKB1-208	ENST00000509165	UNC13D	Q70J99	1090 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFKB1-208	ENST00000509165	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFKB1-208	ENST00000509165	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFKB1-208	ENST00000509165	APOL5	Q9BWW9	433 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFKB1-208	ENST00000509165	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFKB1-208	ENST00000509165	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFKB1-208	ENST00000509165	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFKB1-208	ENST00000509165	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFKB1-208	ENST00000509165	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFKB1-208	ENST00000509165	ITSN1	Q15811	1721 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFKB1-208	ENST00000509165	CRB1	P82279	1406 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NFKB1-208	ENST00000509165	SBF1	O95248	1867 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NFKB1-208	ENST00000509165	USP54	Q70EL1	1684 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NFKB1-208	ENST00000509165		H7C1Q1	480 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	AP4M1	O00189	453 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	PMPCB	O75439	489 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	RASAL1	O95294	804 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	CELA2A	P08217	269 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	HGF	P14210	728 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	FPR3	P25089	353 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	EPHA3	P29320	983 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	GK	P32189	559 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	CPT1A	P50416	773 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	SLC29A2	Q14542	456 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	SMIM5	Q71RC9	77 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	DDB2	Q92466	427 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	TTC17	Q96AE7	1141 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	RAB27B	O00194	218 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	ADAMTS3	O15072	1205 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	A1BG	P04217	495 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	SLC5A1	P13866	664 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	PRKAR1B	P31321	381 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	TUBA4A	P68366	448 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	CHSY1	Q86X52	802 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	YAF2	Q8IY57	180 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	TERB1	Q8NA31	727 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	SNX22	Q96L94	193 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	SNX18	Q96RF0	628 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	VPS51	Q9UID3	782 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	CPD	O75976	1380 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	USP6	P35125	1406 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	COL18A1	P39060	1754 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	RGPD5	Q99666	1765 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	AQP7P3	A6NL99	342 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	PRRT4	C9JH25	899 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	SMIM22	K7EJ46	135 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165		M0R3H8	397 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	SPRY2	O43597	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	RGS10	O43665	173 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	PIAS2	O75928	621 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	FGA	P02671	866 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	IL1R2	P27930	398 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	PIK3CB	P42338	1070 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	RENBP	P51606	427 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	ITGA8	P53708	1063 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	RITA1	Q96K30	269 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	ASIC5	Q9NY37	505 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	AMFR	Q9UKV5	643 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	USP22	Q9UPT9	525 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	PIK3C2A	O00443	1686 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	LY75	O60449	1722 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFKB1-208	ENST00000509165	CNTNAP1	P78357	1384 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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