RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 MBTPS1Q14703 1052 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 RASA2Q15283 850 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 LRRC26Q2I0M4 334 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 TRIM60Q495X7 471 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 SLC45A4Q5BKX6 768 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 C4orf22Q6V702 233 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 CYP4X1Q8N118 509 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 SCML4Q8N228 414 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 PYROXD2Q8N2H3 581 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 PYROXD1Q8WU10 500 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 RSPH1Q8WYR4 309 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 SUSD3Q96L08 255 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 VPS37BQ9H9H4 285 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 FETUBQ9UGM5 382 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 ALPK3Q96L96 1907 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 CLUHO75153 1309 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 EBAG9O00559 213 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 CAPN9O14815 690 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 MAP3K6O95382 1288 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 LTFP02788 710 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 TSHRP16473 764 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 TYMPP19971 482 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 AMPD1P23109 780 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 PHBP35232 272 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 MAGEA6P43360 314 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 CDK7P50613 346 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 RABGGTBP53611 331 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 DEUP1Q05D60 604 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 C1orf53Q5VUE5 145 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 VSTM1Q6UX27 236 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 SLC24A5Q71RS6 500 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 BHLHA9Q7RTU4 235 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 ANKMY2Q8IV38 441 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 ATP11CQ8NB49 1132 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 HASPINQ8TF76 798 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 IRGQQ8WZA9 623 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 MAML1Q92585 1016 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 NTAN1Q96AB6 310 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 OLFM3Q96PB7 478 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.056e-7■■■■□ 26
PDE4D-208ENST00000502484 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 TRPV6Q9H1D0 765 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC134Q9H6E4 229 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 PNPLA8Q9NP80 782 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 ARHGEF4Q9NR80 690 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 PIGVQ9NUD9 493 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 RRN3Q9NYV6 651 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 DTLQ9NZJ0 730 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 SLC24A2Q9UI40 661 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 NUP205Q92621 2012 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 SHROOM3Q8TF72 1996 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 TTC3P53804 2025 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 HACD1B0YJ81 288 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 H3BRJ5 948 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 GCATO75600 419 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 DGKIO75912 1065 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 ITGB1P05556 798 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 USP17L7P0C7H9 530 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 CREB1P16220 341 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 FAM189BP81408 668 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 TLE2Q04725 743 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 SCAPQ12770 1279 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 NR1H3Q13133 447 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 EFHC2Q5JST6 749 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 PM20D1Q6GTS8 502 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 OVOS1Q6IE37 1185 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 KCNT2Q6UVM3 1135 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 CHRDL2Q6WN34 429 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 TADA2BQ86TJ2 420 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 FAM126BQ8IXS8 530 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 FBXO36Q8NEA4 188 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 OR10T2Q8NGX3 314 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 SLC7A14Q8TBB6 771 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 RNF139Q8WU17 664 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 LINC01599Q8WXQ3 324 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 HTATIP2Q9BUP3 242 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 KLC2Q9H0B6 622 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 RAB6BQ9NRW1 208 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 ETNK2Q9NVF9 386 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 TBK1Q9UHD2 729 aa8.48□□□□□ -1.05
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