RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 CBX4O00257 560 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 VILLO15195 856 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 KLK10O43240 276 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 TACC1O75410 805 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 AP1G2O75843 785 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 FAM163BP0C2L3 166 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 CISD3P0C7P0 127 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 GAP43P17677 238 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 TNNI1P19237 187 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 ACO1P21399 889 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 PRKCHP24723 683 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 COPAP53621 1224 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 CACNA2D1P54289 1103 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 MFAP3P55082 362 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 ZBTB16Q05516 673 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 VAC14Q08AM6 782 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 TRPC3Q13507 836 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 ALCAMQ13740 583 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 ENPP2Q13822 863 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 GEN1Q17RS7 908 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 SLC45A4Q5BKX6 768 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 C10orf120Q5SQS8 335 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 FBXL19Q6PCT2 694 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 KDM7AQ6ZMT4 941 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 DYMQ7RTS9 669 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 WDR49Q8IV35 697 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 LSMEM2Q8N112 164 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 GPD1LQ8N335 351 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 OXR1Q8N573 874 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 TNIP3Q96KP6 325 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 KCNK16Q96T55 309 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 CBWD1Q9BRT8 395 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 B3GNT5Q9BYG0 378 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 IKZF4Q9H2S9 585 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 DPEP3Q9H4B8 488 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 PCIF1Q9H4Z3 704 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 SGK2Q9HBY8 427 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 KRT82Q9NSB4 513 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 TMEM30AQ9NV96 361 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 ELOVL2Q9NXB9 296 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 TBC1D7Q9P0N9 293 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 IL17BQ9UHF5 180 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 PLA2G4CQ9UP65 541 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 COL12A1Q99715 3063 aa6.48□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 TMEM131Q92545 1883 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 A0A1W2PPC4 97 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 TIMM44O43615 452 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 TSPAN3O60637 253 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 PPP1R37O75864 691 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 TBX18O95935 607 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 DLATP10515 647 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 IDEP14735 1019 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 CKMT2P17540 419 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 PLA2G4AP47712 749 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 GABREP78334 506 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 DAB2P98082 770 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 E2F1Q01094 437 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 GRIN1Q05586 938 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 KCNA1Q09470 495 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 ST3GAL1Q11201 340 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 NFATC3Q12968 1075 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 KCNT1Q5JUK3 1230 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 KIAA0895LQ68EN5 471 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 OR5B17Q8NGF7 314 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 SAP25Q8TEE9 199 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 DDI1Q8WTU0 396 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 SORCS1Q8WY21 1168 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 GOLGA1Q92805 767 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 SLC6A18Q96N87 628 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 DPH1Q9BZG8 443 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 TRIM4Q9C037 500 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 DCLK3Q9C098 648 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 CYLDQ9NQC7 956 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 THSD1Q9NS62 852 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa6.47□□□□□ -1.37
CBX1-205ENST00000495350 FBXO10Q9UK96 956 aa6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms