RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495082.5

SLC13A3-211, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC13A3, Length 1,887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-211ENST00000495082 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa11.96□□□□□ -0.49
SLC13A3-211ENST00000495082 DNMT3LQ9UJW3 386 aa11.96□□□□□ -0.49
SLC13A3-211ENST00000495082 NUDT5Q9UKK9 219 aa11.96□□□□□ -0.49
SLC13A3-211ENST00000495082 AP4E1Q9UPM8 1137 aa11.96□□□□□ -0.49
SLC13A3-211ENST00000495082 MYO7AQ13402 2215 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 TMEM265A0A087WTH1 108 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 CCL16O15467 120 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 XYLBO75191 536 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 TBX18O95935 607 aa11.95□□□□□ -0.5
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SLC13A3-211ENST00000495082 IGLV3-27P01718 113 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 CDC25CP30307 473 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 CCR1P32246 355 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 NRIP1P48552 1158 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 CDH6P55285 790 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 RING1Q06587 406 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 EFEMP1Q12805 493 aa11.95□□□□□ -0.5
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SLC13A3-211ENST00000495082 LONRF2Q1L5Z9 754 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 EFHC2Q5JST6 749 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 MFSD7Q6UXD7 560 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa11.95□□□□□ -0.5
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SLC13A3-211ENST00000495082 LEMD2Q8NC56 503 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 ZNF670Q9BS34 389 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 OSBPL8Q9BZF1 889 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 ZNF576Q9H609 170 aa11.95□□□□□ -0.5
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SLC13A3-211ENST00000495082 ASAH2Q9NR71 780 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 COX16Q9P0S2 106 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 CTAGE15A4D2H0 777 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 KCNU1A8MYU2 1149 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 PI4K2BG5E9Z4 385 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 RFXAPO00287 272 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 MSI1O43347 362 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 COCHO43405 550 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 RFPL2O75678 378 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 OLFM2O95897 454 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 CTAGE8P0CG41 777 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 PFKLP17858 780 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 L1CAMP32004 1257 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 MTA1Q13330 715 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 DPYSL3Q14195 570 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 CA9Q16790 459 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
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SLC13A3-211ENST00000495082 CTAGE4Q8IX94 777 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 SPATA4Q8NEY3 305 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 MAIP1Q8WWC4 291 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 FAF2Q96CS3 445 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 HAPLN3Q96S86 360 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 PRKD2Q9BZL6 878 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 TKTL2Q9H0I9 626 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 ANLNQ9NQW6 1124 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 MTMR10Q9NXD2 777 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 LMCD1Q9NZU5 365 aa11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 I6L893 689 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 CD48P09326 243 aa11.94□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 PTPN2P17706 415 aa11.94□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 IL4RP24394 825 aa11.94□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 GABRR2P28476 465 aa11.94□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 TBX4P57082 545 aa11.94□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 KRT81Q14533 505 aa11.94□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 MIB1Q86YT6 1006 aa11.94□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 RNF34Q969K3 372 aa11.94□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 CORO1BQ9BR76 489 aa11.94□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 OSBPL2Q9H1P3 480 aa11.94□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 DZANK1Q9NVP4 752 aa11.94□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 RASAL2Q9UJF2 1139 aa11.94□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 TRANK1O15050 2925 aa11.94□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 SLC12A8A0AV02 714 aa11.93□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 C2orf78A6NCI8 922 aa11.93□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 SOBPA7XYQ1 873 aa11.93□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 KRIT1O00522 736 aa11.93□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 TJP3O95049 919 aa11.93□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 TUBB4BP68371 445 aa11.93□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 SEMA3BQ13214 749 aa11.93□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa11.93□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 HS6ST3Q8IZP7 471 aa11.93□□□□□ -0.5
SLC13A3-211ENST00000495082 VN1R2Q8NFZ6 395 aa11.93□□□□□ -0.5
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