RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 TSPAN16Q9UKR8 245 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 SAR1BQ9Y6B6 198 aa7.51□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 PALMO75781 387 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 DGKIO75912 1065 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 OR1G1P47890 313 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 CACNA2D1P54289 1103 aa7.5□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 RASIP1Q5U651 963 aa7.5□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 WDTC1Q8N5D0 677 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 ANKRD52Q8NB46 1076 aa7.5□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 TOP1MTQ969P6 601 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 CENPTQ96BT3 561 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 ITPKCQ96DU7 683 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 ACBD6Q9BR61 282 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 C11orf70Q9BRQ4 267 aa7.5□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 RAB17Q9H0T7 212 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 PARVAQ9NVD7 372 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 CACNG4Q9UBN1 327 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 KANSL1LA0AUZ9 987 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 TTC34A8MYJ7 566 aa7.5□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 NRP1O14786 923 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 B4GALT3O60512 393 aa7.5□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 ITGB8P26012 769 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 SCNN1AP37088 669 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 HALP42357 657 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 BRCC3P46736 316 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 RPL34P49207 117 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 NCALDP61601 193 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 WDR5P61964 334 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 PLCB3Q01970 1234 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 ORC1Q13415 861 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 GSTA3Q16772 222 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 MEI1Q5TIA1 1274 aa7.5□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 DPEP3Q9H4B8 488 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 TMBIM4Q9HC24 238 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 FAIMQ9NVQ4 179 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 ADAM28Q9UKQ2 775 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 HYOU1Q9Y4L1 999 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP7.5□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 GSTT2P0CG29 244 aa7.49□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 TCP1P17987 556 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 MAN1A1P33908 653 aa7.49□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 RAB15P59190 212 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 FPGSQ05932 587 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 PTPN20Q4JDL3 420 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 OVOS1Q6IE37 1185 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 DNAJC24Q6P3W2 148 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM171BQ6P995 826 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 C12orf29Q8N999 325 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC35F5Q8WV83 523 aa7.49□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 RAPGEF5Q92565 580 aa7.49□□□□□ -1.21
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