RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	TAP1	Q03518	808 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	PDE4C	Q08493	712 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	MYO1E	Q12965	1108 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	GPS1	Q13098	491 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	CALCOCO2	Q13137	446 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	DPYSL3	Q14195	570 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	CGB2	Q6NT52	195 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	HOOK3	Q86VS8	718 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	RFX6	Q8HWS3	928 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	PRR7	Q8TB68	274 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	HSPH1	Q92598	858 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	LPP	Q93052	612 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM161B	Q96MY7	647 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC9A7	Q96T83	725 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	YME1L1	Q96TA2	773 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	RAD9A	Q99638	391 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	PBX4	Q9BYU1	374 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM107B	Q9H098	131 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	USP29	Q9HBJ7	922 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	MIOS	Q9NXC5	875 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	CNTN3	Q9P232	1028 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	INSL6	Q9Y581	213 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		6.05	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	LCHN	A4D1U4	455 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	KRBA1	A5PL33	1030 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	PTGES	O14684	152 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	LILRB3	O75022	631 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF623	O75123	536 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	DGKI	O75912	1065 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	BEST1	O76090	585 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	TJP3	O95049	919 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	MAP3K6	O95382	1288 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	EOMES	O95936	686 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	GAS8	O95995	478 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	C1QA	P02745	245 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	ITGAV	P06756	1048 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	CA3	P07451	260 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	PDGFRB	P09619	1106 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	SKI	P12755	728 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	PDGFRA	P16234	1089 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	ADORA2B	P29275	332 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	FOXN2	P32314	431 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	HDAC4	P56524	1084 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC6A3	Q01959	620 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	CAV1	Q03135	178 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	MTM1	Q13496	603 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	LRRC14	Q15048	493 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	NOMO1	Q15155	1222 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	NOTUM	Q6P988	496 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM110	Q86TL2	294 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		6.04	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	PLD5	Q8N7P1	536 aa		6.04	□□□□□ -1.44

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