RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
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TOM1-216ENST00000492723 RSPH1Q8WYR4 309 aa17.33■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 PPCSQ9HAB8 311 aa17.33■□□□□ 0.36
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TOM1-216ENST00000492723 CYP11A1P05108 521 aa17.32■□□□□ 0.36
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TOM1-216ENST00000492723 LGMNQ99538 433 aa17.31■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 KIF9Q9HAQ2 790 aa17.31■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 DDIT4Q9NX09 232 aa17.31■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 MYO1CO00159 1063 aa17.31■□□□□ 0.36
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TOM1-216ENST00000492723 BHLHA9Q7RTU4 235 aa17.3■□□□□ 0.36
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TOM1-216ENST00000492723 THEM5Q8N1Q8 247 aa17.3■□□□□ 0.36
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TOM1-216ENST00000492723 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 RGS18Q9NS28 235 aa17.3■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP17.3■□□□□ 0.36
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TOM1-216ENST00000492723 FAM47DPA6NHR8 397 aa17.3■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 HACD1B0YJ81 288 aa17.3■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 C9IYK1 514 aa17.3■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 FAM72CH0Y354 149 aa17.3■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 VAV1P15498 845 aa17.3■□□□□ 0.36
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TOM1-216ENST00000492723 CORO7P57737 925 aa17.3■□□□□ 0.36
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TOM1-216ENST00000492723 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
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TOM1-216ENST00000492723 C4orf33Q8N1A6 199 aa17.3■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP17.3■□□□□ 0.369e-20■■■■■ 206
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TOM1-216ENST00000492723 CABS1Q96KC9 395 aa17.3■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 SUSD3Q96L08 255 aa17.3■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 SMC6Q96SB8 1091 aa17.3■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa17.3■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 ANLNQ9NQW6 1124 aa17.3■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 MSH2P43246 934 aa17.29■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 TSPY1Q01534 308 aa17.29■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 AP1B1Q10567 949 aa17.29■□□□□ 0.36
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