RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	POTEA	Q6S8J7	498 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	MPP5	Q8N3R9	675 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	RNF149	Q8NC42	400 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	TFAP2B	Q92481	460 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	CCNE2	O96020	404 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	MGAT1	P26572	445 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	CRABP2	P29373	138 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PHKA2	P46019	1235 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	TBCC	Q15814	346 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SP8	Q8IXZ3	490 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	KY	Q8NBH2	561 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	GIPC3	Q8TF64	312 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	RNF19A	Q9NV58	838 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	RRN3	Q9NYV6	651 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	COL4A1	P02462	1669 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SERPINE1	P05121	402 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SFN	P31947	248 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	CBX3	Q13185	183 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	TLR1	Q15399	786 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	CHSY1	Q86X52	802 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	C4orf19	Q8IY42	314 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PTPRJ	Q12913	1337 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	CRTAM	O95727	393 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	GART	P22102	1010 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC12A2	P55011	1212 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	TAP1	Q03518	808 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SPP2	Q13103	211 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	RPS6KA2	Q15349	733 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292		Q3C1V9	767 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	MASTL	Q96GX5	879 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	C7orf26	Q96N11	449 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	HESX1	Q9UBX0	185 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	FEM1B	Q9UK73	627 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	GLRA3	O75311	464 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	CCND2	P30279	289 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ALDH1B1	P30837	517 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SERPINB9	P50453	376 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ACTR2	P61160	394 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM198	Q66K66	360 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	AAGAB	Q6PD74	315 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	TMC7	Q7Z402	723 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ARL10	Q8N8L6	244 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	COG4	Q9H9E3	785 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	GPAM	Q9HCL2	828 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	KPNA7	A9QM74	516 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	VNN1	O95497	513 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	GPD1	P21695	349 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	GRIA2	P42262	883 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PGGT1B	P53609	377 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	HPCA	P84074	193 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	CCNI	Q14094	377 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	C16orf89	Q6UX73	402 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	AZIN2	Q96A70	460 aa		10.11	□□□□□ -0.79

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