RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 DACT1Q9NYF0 836 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 GRHPRQ9UBQ7 328 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 TLK1Q9UKI8 766 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 AMFRQ9UKV5 643 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 CA14Q9ULX7 337 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 SHANK2Q9UPX8 1470 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 NPATQ14207 1427 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 A8MVJ9 347 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 M0R3H8 397 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 FCHO1O14526 889 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF213O14771 459 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 KIAA0355O15063 1070 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 DHHO43323 396 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 GLP2RO95838 553 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 FGAP02671 866 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP3.79□□□□□ -1.81e-8■■■□□ 14.6
RABGGTB-211ENST00000489450 ANXA6P08133 673 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 ITGA5P08648 1049 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 GYS1P13807 737 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 ADRA1DP25100 572 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 SERPINF1P36955 418 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 CLK3P49761 638 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 DIO1P49895 249 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 TGFB2P61812 414 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 CYP4F2P78329 520 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 LMAN2Q12907 356 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 GRM4Q14833 912 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 ST3GAL2Q16842 350 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 TBC1D25Q3MII6 688 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM196Q5HYL7 178 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 AKNAD1Q5T1N1 836 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 LIN54Q6MZP7 749 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 AMIGO2Q86SJ2 522 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 GATAD2AQ86YP4 633 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 EXOC8Q8IYI6 725 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 OR1N1Q8NGS0 311 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 UROC1Q96N76 676 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 MAGEH1Q9H213 219 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 CPNE5Q9HCH3 593 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 HELLSQ9NRZ9 838 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC17A6Q9P2U8 582 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 MGAT4CQ9UBM8 478 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 ADAM21Q9UKJ8 722 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 MROH1Q8NDA8 1641 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 ARHGAP5Q13017 1502 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 MAP3K1Q13233 1512 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 A2ML1A8K2U0 1454 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 IQGAP1P46940 1657 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 LRP6O75581 1613 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 DNPH1O43598 174 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 TMPRSS11DO60235 418 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 EXOC3O60645 756 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 TAF5LO75529 589 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 NTSR2O95665 410 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 AKT1P31749 480 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 HALP42357 657 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 BFSP2Q13515 415 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 P3H1Q32P28 736 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 SULT6B1Q6IMI4 303 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 KIRREL2Q6UWL6 708 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC29A4Q7RTT9 530 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF804AQ7Z570 1209 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 ARHGEF25Q86VW2 580 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 TBC1D5Q92609 795 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 VPS50Q96JG6 964 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 MMS19Q96T76 1030 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 KATNAL1Q9BW62 490 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 PRDM13Q9H4Q3 707 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 SAP30LQ9HAJ7 183 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 SH3BP4Q9P0V3 963 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 DEPDC5O75140 1603 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-211ENST00000489450 SYNMO15061 1565 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-211ENST00000489450 CPS1P31327 1500 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-211ENST00000489450 ATP7AQ04656 1500 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-211ENST00000489450 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-211ENST00000489450 PIP5K1CO60331 668 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-211ENST00000489450 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-211ENST00000489450 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-211ENST00000489450 GRK6P43250 576 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-211ENST00000489450 GSTM5P46439 218 aa3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms