RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 POMPQ9Y244 141 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 GINS2Q9Y248 185 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 SERPINB5P36952 375 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 ITGA9Q13797 1035 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 RNF111Q6ZNA4 994 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD23Q86SG2 305 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 DCAKDQ8WVC6 231 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 KLRG1Q96E93 195 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 RRN3Q9NYV6 651 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 STRIP2Q9ULQ0 834 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 GOLGA8OA6NCC3 632 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 GOLGA8NF8WBI6 632 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 UGT1A9O60656 530 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 PDGFRBP09619 1106 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 FGFR3P22607 806 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 NXNQ6DKJ4 435 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 IGDCC3Q8IVU1 814 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC33Q8N5R6 958 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 TTC13Q8NBP0 860 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 LZICQ8WZA0 190 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 CPT1BQ92523 772 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 UGT1A7Q9HAW7 530 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 UGT1A10Q9HAW8 530 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 UGT1A8Q9HAW9 530 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 ACSS2Q9NR19 701 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 SELENONQ9NZV5 590 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 THEGQ9P2T0 379 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 TJP2Q9UDY2 1190 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa16.73■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 PSTPIP1O43586 416 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 FAM58BPP0C7Q3 252 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 RPL22P35268 128 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 NUDT2P50583 147 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 MAMLD1Q13495 774 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 SPDYAQ5MJ70 313 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 METTL25Q8N6Q8 603 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 GAB3Q8WWW8 586 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF606Q8WXB4 792 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 PORCNQ9H237 461 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 ARMC7Q9H6L4 198 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 ELP3Q9H9T3 547 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 CDH22Q9UJ99 828 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 PLA2G4CQ9UP65 541 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 CLEC11AQ9Y240 323 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 PDLIM1O00151 329 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 MAFGO15525 162 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM63AO94886 807 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 STIP1P31948 543 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 ENTPD1P49961 510 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 SLC18A1P54219 525 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 CDH8P55286 799 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 CCNIQ14094 377 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 EML3Q32P44 896 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 HSDL1Q3SXM5 330 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 FEZF2Q8TBJ5 459 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM11Q96F44 468 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 ABHD8Q96I13 439 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 SLITRK1Q96PX8 696 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 GPAMQ9HCL2 828 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 RAB6BQ9NRW1 208 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 UBAP1Q9NZ09 502 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1B0GTW7 788 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 B4GALT5O43286 388 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 TNFAIP8O95379 198 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 TMED10P49755 219 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 C16orf87Q6PH81 154 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 EME1Q96AY2 570 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 TMIGD2Q96BF3 282 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 PGBD4Q96DM1 585 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 C17orf75Q9HAS0 396 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 PDLIM7Q9NR12 457 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 RNF19AQ9NV58 838 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 KIF13BQ9NQT8 1826 aa16.72■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 CRTAMO95727 393 aa16.71■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 APRTP07741 180 aa16.71■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 RBP3P10745 1247 aa16.71■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 VGLL4Q14135 290 aa16.71■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 FLOT2Q14254 428 aa16.71■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 KATNAL2Q8IYT4 538 aa16.71■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 ABRAQ8N0Z2 381 aa16.71■□□□□ 0.27
CCSAP-204ENST00000483092 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms