RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482054.1

CTSL-205, Transcript of cathepsin L, human

TSL 2

Gene CTSL, Length 908 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSL-205	ENST00000482054	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CTSL-205	ENST00000482054	CD58	P19256	250 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CTSL-205	ENST00000482054	PLA2G4A	P47712	749 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CTSL-205	ENST00000482054	VAMP7	P51809	220 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CTSL-205	ENST00000482054	KIF11	P52732	1056 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CTSL-205	ENST00000482054	SLC14A1	Q13336	389 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CTSL-205	ENST00000482054	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CTSL-205	ENST00000482054	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CTSL-205	ENST00000482054	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CTSL-205	ENST00000482054	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CTSL-205	ENST00000482054	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CTSL-205	ENST00000482054	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CTSL-205	ENST00000482054	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CTSL-205	ENST00000482054	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CTSL-205	ENST00000482054	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CTSL-205	ENST00000482054	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	CILP	O75339	1184 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	KIF20A	O95235	890 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	SYP	P08247	313 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	GCLM	P48507	274 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	PPP3CA	Q08209	521 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	PKP1	Q13835	747 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	GEN1	Q17RS7	908 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	FUT11	Q495W5	492 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	ATL3	Q6DD88	541 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	GLRX5	Q86SX6	157 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	NAXD	Q8IW45	347 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	FOXJ1	Q92949	421 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	FBXO10	Q9UK96	956 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	CFAP45	Q9UL16	551 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	MAPK13	O15264	365 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	CBFA2T3	O75081	653 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	PFKFB1	P16118	471 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	NR2F2	P24468	414 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	MAOB	P27338	520 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	CD6	P30203	668 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	PSEN1	P49768	467 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	MFAP3	P55082	362 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	CYP4F3	Q08477	520 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	STARD3	Q14849	445 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	FYB2	Q5VWT5	728 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	ZNF276	Q8N554	614 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	SNX21	Q969T3	373 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	DUSP16	Q9BY84	665 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	USP3	Q9Y6I4	520 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	COL12A1	Q99715	3063 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054		A0A1B0GVL5	298 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	HMBS	P08397	361 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	RALA	P11233	206 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	GNS	P15586	552 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	CHKA	P35790	457 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	IL12RB1	P42701	662 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	EFEMP1	Q12805	493 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	GRIK2	Q13002	908 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	ENPP2	Q13822	863 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	ZNF394	Q53GI3	561 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	GPR174	Q9BXC1	333 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	MYH10	P35580	1976 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	MEI4	A8MW99	385 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	KCNJ18	B7U540	433 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	NPC1	O15118	1278 aa		13.55	□□□□□ -0.24

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