RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 GTSE1Q9NYZ3 720 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 ITGA11Q9UKX5 1188 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 CCL26Q9Y258 94 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 ASB3Q9Y575 518 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 PIAS3Q9Y6X2 628 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 CCDC66A2RUB6 948 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 A6NNZ2 444 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 PROB1E7EW31 1015 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 KCNK3O14649 394 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 LAMTOR5O43504 91 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 RTN2O75298 545 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 MICAL2O94851 1124 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 FTCDO95954 541 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 CST3P01034 146 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 PNPLA4P41247 253 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 AP3M2P53677 418 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 GALCP54803 685 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 BPIFB4P59827 614 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 GCNT1Q02742 428 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 CYP24A1Q07973 514 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 MTAPQ13126 283 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 FZD5Q13467 585 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 DUOXA2Q1HG44 320 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 TUBB8Q3ZCM7 444 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 WDR44Q5JSH3 913 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 ZNF852Q6ZMS4 543 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 TMEM150AQ86TG1 271 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 ZNF677Q86XU0 584 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 RASGEF1CQ8N431 466 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 DCLK2Q8N568 766 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 LRRC52Q8N7C0 313 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 LEMD2Q8NC56 503 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 FBXL13Q8NEE6 735 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 CCDC26Q8TAB7 109 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 SPPL2BQ8TCT7 592 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 PARD3BQ8TEW8 1205 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 WHAMMQ8TF30 809 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 DNASE1L2Q92874 299 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 IRF7Q92985 503 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 CAVIN3Q969G5 261 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 GCNAQ96QF7 691 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 HINFPQ9BQA5 517 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 PACSIN1Q9BY11 444 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 GPR88Q9GZN0 384 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 ISCUQ9H1K1 167 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 CARD9Q9H257 536 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 LMAN1LQ9HAT1 526 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 TRPV4Q9HBA0 871 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 TRPC7Q9HCX4 862 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 CRTAC1Q9NQ79 661 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 GDF3Q9NR23 364 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 TMEM59LQ9UK28 342 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 NME7Q9Y5B8 376 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.57□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 THADAQ6YHU6 1953 aa6.56□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa6.56□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 TMCO5BA8MYB1 307 aa6.56□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 OPA1O60313 960 aa6.56□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 MTA2O94776 668 aa6.56□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 F11P03951 625 aa6.56□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 BDNFP23560 247 aa6.56□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 PAX3P23760 479 aa6.56□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 RAP1GAPP47736 663 aa6.56□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 GCLMP48507 274 aa6.56□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 PDE6CP51160 858 aa6.56□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 MYL6P60660 151 aa6.56□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 PPP3CAQ08209 521 aa6.56□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 MYO1EQ12965 1108 aa6.56□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 CUL1Q13616 776 aa6.56□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 PON2Q15165 354 aa6.56□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 ARHGAP44Q17R89 818 aa6.56□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.56□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 MDH1BQ5I0G3 518 aa6.56□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 ALS2CLQ60I27 953 aa6.56□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 C11orf63Q6NUN7 778 aa6.56□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 GJB7Q6PEY0 223 aa6.56□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.56□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 MAATS1Q7Z4T9 603 aa6.56□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 DAAM2Q86T65 1068 aa6.56□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 NT5DC3Q86UY8 548 aa6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms