RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474230.5

NFU1-209, Transcript of NFU1 iron-sulfur cluster scaffold, human

TSL 3

Gene NFU1, Length 666 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFU1-209	ENST00000474230	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	MORN5	Q5VZ52	161 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	MAP4K1	Q92918	833 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	FCHO1	O14526	889 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	TAF5L	O75529	589 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	ITGA5	P08648	1049 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	CDK4	P11802	303 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	NPPB	P16860	134 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	MATN1	P21941	496 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	MMP8	P22894	467 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	THBS4	P35443	961 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	TEC	P42680	631 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	GSTM5	P46439	218 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	MUL1	Q969V5	352 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	MAFF	Q9ULX9	164 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	WDR91	A4D1P6	747 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230		E5RJQ4	531 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	NPC1	O15118	1278 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	SETSIP	P0DME0	302 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	ALAD	P13716	330 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	STARD3	Q14849	445 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	ACSM6	Q6P461	480 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	GLMP	Q8WWB7	406 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	VPS4A	Q9UN37	437 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230		A0A087WV62	115 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	AQP12B	A6NM10	295 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	PRY	O14603	147 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	RRH	O14718	337 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	DSCR3	O14972	297 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	PIP5K1B	O14986	540 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	ANXA6	P08133	673 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	NDUFS1	P28331	727 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	SMARCA2	P51531	1590 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	YPEL5	P62699	121 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	CFHR1	Q03591	330 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	GAB1	Q13480	694 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	CSHL1	Q14406	222 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	C16orf89	Q6UX73	402 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	CNGA4	Q8IV77	575 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	5.78	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	P2RY11	Q96G91	374 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	ZNF778	Q96MU6	729 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	NUAK2	Q9H093	628 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
NFU1-209	ENST00000474230	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	TP73	O15350	636 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	GRM4	Q14833	912 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	ELF2	Q15723	593 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	CNGA3	Q16281	694 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	P3H1	Q32P28	736 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	SKAP1	Q86WV1	359 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	NPIPB3	Q92617	1050 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	FFAR2	O15552	330 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	ASNA1	O43681	348 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	KLRK1	P26718	216 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	TACR3	P29371	465 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NFU1-209	ENST00000474230	HOXD12	P35452	270 aa		5.76	□□□□□ -1.49

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