RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474040.5

HOXB-AS3-206, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 741 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TCF4P15884 667 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TCF3P15923 654 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CTNNA2P26232 953 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 IL1R2P27930 398 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CCR1P32246 355 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TBX4P57082 545 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TAS2R40P59535 323 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 GNG11P61952 73 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ETF1P62495 437 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SCAPQ12770 1279 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 MTA1Q13330 715 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 HADHQ16836 314 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 MEI1Q5TIA1 1274 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 POTEHQ6S545 545 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 EP400NLQ6ZTU2 488 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 RHOT1Q8IXI2 618 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SLC35F6Q8N357 371 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TEKT4Q8WW24 435 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PLD4Q96BZ4 506 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 HES6Q96HZ4 224 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PEBP4Q96S96 227 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CYP2S1Q96SQ9 504 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 GDE1Q9NZC3 331 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 AMFRQ9UKV5 643 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 USP18Q9UMW8 372 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 JRKLQ9Y4A0 524 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 DENND4AQ7Z401 1863 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CCDC66A2RUB6 948 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PRPSAP2O60256 369 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CKMP06732 381 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 KRT7P08729 469 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ADRA1BP35368 520 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 BOLA3Q53S33 107 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 NUGGCQ68CJ6 796 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 FAM131BQ86XD5 332 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 KIAA1958Q8N8K9 716 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ING5Q8WYH8 240 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 FGF13Q92913 245 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ZSWIM3Q96MP5 696 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 WDR24Q96S15 920 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TLR10Q9BXR5 811 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 WDCPQ9H6R7 721 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CDH7Q9ULB5 785 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CPQQ9Y646 472 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 DOCK6Q96HP0 2047 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SZT2Q5T011 3432 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 I6L893 689 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 FANCGO15287 622 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 GREM1O60565 184 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 STC2O76061 302 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 KCNA5P22460 613 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 AVPR1AP37288 418 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PEX5P50542 639 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ZXDBP98169 803 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ARL13BQ3SXY8 428 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SCYL2Q6P3W7 929 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 UNC45BQ8IWX7 931 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CCDC185Q8N715 623 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 HLA-CQ95604 372 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 AZIN2Q96A70 460 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 HAPLN3Q96S86 360 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TKTL2Q9H0I9 626 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 POMKQ9H5K3 350 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TRPV4Q9HBA0 871 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ANLNQ9NQW6 1124 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 GKN1Q9NS71 199 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TDP1Q9NUW8 608 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 COX16Q9P0S2 106 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PCSK1NQ9UHG2 260 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 FZD10Q9ULW2 581 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 GRXCR2A6NFK2 248 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-206ENST00000474040 H3BQ06 376 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-206ENST00000474040 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PRAMEF12O95522 483 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-206ENST00000474040 LATS1O95835 1130 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-206ENST00000474040 APOEP02649 317 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-206ENST00000474040 RARAP10276 462 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SSR1P43307 286 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-206ENST00000474040 KCNQ1P51787 676 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms